Gène
PIK3CD
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta
- HGNC 8977↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000171608↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 5293↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 1p36.22
- Coordonnées
- Chromosome 1 : 9 651 731–9 729 114 (GRCh38)
- Exons
- 24 exons sur 77,4 kb
- Protéine
- 1 044 acides aminés
- Hérédité
- Autosomique dominant
- Aussi appelé
- p110D
- Transcrit MANE Select
- ENST00000377346.9NM_005026.5
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Syndrome d'activation de la PI3K-delta (APDS)
- Syndrome d'activation de la PI3K-deltaAutosomique dominant
Immunodéficience avec lymphoprolifération causée par une seule modification activatrice de PIK3CD ou de PIK3R1.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Un diagnostic génétique permet un traitement ciblé par le léniolisib, un inhibiteur de la PI3K-delta, associé à un remplacement par immunoglobulines et à une surveillance du lymphome.
Regroupements plus larges
Autres erreurs innées de l'immunité
- Erreur innée de l'immunité
L'un des 114 gènes qui lui sont liés
Maladies héréditaires du système immunitaire causées par des modifications de gènes uniques, qui affectent la manière dont l'organisme combat les infections ou régule l'inflammation.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Déficit immunitaire
L'un des 170 gènes qui lui sont liés
Maladie caractérisée par une déficience ou une anomalie des mécanismes de l'immunité, qu'elle soit cellulaire ou humorale.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
HSCT pour le SCID et les DIP sévères ; traitement substitutif par immunoglobulines (IVIG/SCIG) pour les déficits en anticorps ; leniolisib (Joenja, FDA 2023) pour l'APDS ; thérapie génique pour l'ADA-SCID ; abatacept pour le déficit en CTLA4/LRBA ; antibioprophylaxie ; G-CSF pour la CGD
Transmission
- Autosomique dominant
- Une copie modifiée, provenant de l'un ou l'autre parent, suffit. Un parent qui en porte une la transmet à chacun de ses enfants avec une probabilité de une sur deux.
Structure de PIK3CD
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
- Variants avec une page
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,4 kb sur les 77,4 kb du gène ; 3 135 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit PIK3CD
26
positions dans PIK3CD où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
2 d'entre elles (7,7 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Segmental duplications (2 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un génome entier couvre les 77,4 kb de PIK3CD, introns compris, et pas seulement les 5,4 kb d'exons.
Variants avec une page (12)
Les variants PIK3CD disposant d'une page ici, ceux avec le plus d'étoiles de révision en premier. Chaque page décrit le dossier public de ClinVar sur le variant, jamais un résultat.
| Variant | HGVS c. | Exon ou intron | Position (GRCh38) | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|---|---|
| c.1002C>G | Exon 8 | 9 717 608 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts | |
| C416R | c.1246T>C | Exon 10 | 9 719 924 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E81K | c.241G>A | Exon 4 | 9 715 640 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E525A | c.1574A>C | Exon 13 | 9 720 794 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E525G | c.1574A>G | Exon 13 | 9 720 794 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E525K | c.1573G>A | Exon 13 | 9 720 793 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E1021K | c.3061G>A | Exon 24 | 9 726 972 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| E1025G | c.3074A>G | Exon 24 | 9 726 985 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| G124D | c.371G>A | Exon 5 | 9 715 849 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| N334K | c.1002C>A | Exon 8 | 9 717 608 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
Gènes liés aux mêmes affections
- PIK3R1phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1Partage 3 affections
- AICDAactivation induced cytidine deaminasePartage 2 affections
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Partage 2 affections
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorPartage 2 affections
- BCL11BBCL11 transcription factor BPartage 2 affections
- BLNKB cell linkerPartage 2 affections
- BTKBruton tyrosine kinasePartage 2 affections
- C1QAcomplement C1q A chainPartage 2 affections
- C1QBcomplement C1q B chainPartage 2 affections
- C1QCcomplement C1q C chainPartage 2 affections
- C1Scomplement C1sPartage 2 affections
- C2complement C2Partage 2 affections
Traits associés à PIK3CD
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que PIK3CD peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the immune system
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Recurrent ear infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Recurrent skin infections
- Skin rash
Afficher 18 traits supplémentaires
- Autoimmunity
- Bone infection
- Combined immunodeficiency
- Decreased specific antibody response to vaccination
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent aspiration pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent fungal infections
- Recurrent viral infections
- Chronic active EBV infection
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Persistent human papillomavirus infection
- Recurrent Candida infection
- Unusual molluscum contagiosum
- Disseminated cryptosporidium infection
- Pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Abnormality of head or neck
- Recurrent sinus disease
- Pink eye
- Sinus disease
- Abnormal facial shape
- Abnormality of the chin
- Baggy eyes
- Broad nasal tip
- Chronic oral thrush
Afficher 16 traits supplémentaires
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Agammaglobulinemia
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Increased circulating IgM concentration
- Chronic decreased circulating IgA concentration
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Elevated white blood count
- High blood monocyte number
- Increased blood neutrophil counts
- Increased number of platelets in blood
- Low B cell count
- Increased transitional B cell proportion
- Abnormal T cell subset number
- Decreased class-switched memory B cell proportion
Afficher 4 traits supplémentaires
Abnormality of the digestive system
- Candida esophagitis
- Chronic diarrhea
- Colitis
- Inflammation of the large intestine
- Diarrhea
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Intestinal lymphoid nodular hyperplasia
Afficher 4 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène PIK3CD : phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pik3cd
Dante Labs. Gène PIK3CD : phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pik3cd
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