Gen
PIK3CD
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta
- HGNC 8977↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000171608↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 5293↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 1p36.22
- Koordinatlar
- Kromozom 1: 9.651.731–9.729.114 (GRCh38)
- Eksonlar
- 77,4 kb boyunca 24 ekson
- Protein
- 1.044 amino asit
- Diğer adları
- p110D
- MANE Select transkripti
- ENST00000377346.9NM_005026.5
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pik3cd.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePIK3CD ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Aktive PI3K-Delta Sendromu (APDS)
- Aktive PI3K-delta sendromuOtozomal dominant
PIK3CD veya PIK3R1 genindeki tek bir aktive edici değişiklikten kaynaklanan, lenfoproliferasyonla birlikte seyreden immün yetmezlik.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 4 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Genetik tanı, immünoglobulin replasmanı ve lenfoma takibiyle birlikte, bir PI3K-delta inhibitörü olan lenyolisib ile hedefe yönelik tedaviye olanak tanır.
Daha geniş gruplar
Diğer Doğuştan İmmün Yetmezlikler
- Bağışıklık yetmezliğinin kalıtsal formu
Buna bağlı 114 gen arasından biri
Tek genlerdeki değişikliklerden kaynaklanan, vücudun enfeksiyonlarla savaşma veya iltihaplanmayı düzenleme becerisini etkileyen kalıtsal bağışıklık sistemi bozuklukları.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 4 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
- İmmün Yetmezlik Hastalığı
Buna bağlı 170 gen arasından biri
Hücresel veya humoral bağışıklık mekanizmalarında eksiklik ya da bozukluk bulunan hastalık.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 4 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Ağır kombine immün yetmezlik (SCID) ve ağır primer immün yetmezlikler için HSCT; antikor eksikliklerinde immünoglobulin replasmanı (IVIG/SCIG); APDS için lenyolisib (Joenja, FDA 2023); ADA-SCID için gen tedavisi; CTLA4/LRBA eksikliği için abatasept; profilaktik antibiyotikler; KGH için G-CSF
PIK3CD geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 77,4 kb uzunluğunun 5,4 kb'sini oluşturur; bu bazların 3.135 tanesi proteini kodlar.
PIK3CD dizilemesi
14Orta
PIK3CD geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
PIK3CD geninin eksonlarının bir kısmı, kısa okumaların bir değişikliği kaçırabileceği ya da yanlış yere yerleştirebileceği yerlerde bulunuyor.
Buna ek olarak: PIK3CD geninin eksonlarının her zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölümler; bu nedenle burada yapılan bir tespit eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi, genomun başka yerlerindeki %90 veya daha yüksek benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%36
- TekrarlarArdışık tekrarlar ve tek bazlı diziler; okumalar bunların üzerinde kayabilir ve tamamını kapsayamayabilir. Ağırlık %15.%1,7
- GC içeriğiYüzde 25'in altında ya da yüzde 65'in üzerinde G ve C içeren pencereler; kütüphane hazırlığı bunları zayıf kapsar. Ağırlık %10.%30
- Referans kapsamıYakındaki referans dizisindeki boşluklar; okumaların hizalanabileceği bir dizi bulunmayan yerler. Ağırlık %10.%0
Dante Labs'in kendi araştırmasından elde edilen bir puan; NIST'in Genome in a Bottle haritaları, dizilemesi zor bölgeler üzerine kuruludur.Puanlama yöntemiHer çubuk, PIK3CD geninin ekson bazlarının o zor bölge türünde bulunan payını gösterir. Herhangi bir tür tek başına bir geni zor hale getirebilir; her ek tür ise daha az katkı yapar: hiçbir baz herhangi birinde yoksa 0, her baz okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgedeyse 100.
26
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı PIK3CD konumları
Bunların 2 tanesi (%7,7), kısa okumaların zorlandığı bölgelere düşüyor.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (2 konum)
Tüm genom dizilemesi, intronlar dahil PIK3CD geninin 77,4 kb'lık tamamını kapsar; yalnızca eksonların 5,4 kb'lık kısmını değil.
Sayfası olan varyantlar (12)
Burada sayfası bulunan PIK3CD varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| c.1002C>G | Ekzon 8 | 9.717.608 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| C416R | c.1246T>C | Ekzon 10 | 9.719.924 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E81K | c.241G>A | Ekzon 4 | 9.715.640 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E525A | c.1574A>C | Ekzon 13 | 9.720.794 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E525G | c.1574A>G | Ekzon 13 | 9.720.794 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E525K | c.1573G>A | Ekzon 13 | 9.720.793 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E1021K | c.3061G>A | Ekzon 24 | 9.726.972 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| E1025G | c.3074A>G | Ekzon 24 | 9.726.985 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| G124D | c.371G>A | Ekzon 5 | 9.715.849 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| N334K | c.1002C>A | Ekzon 8 | 9.717.608 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
ClinVar pathogenic variants (29)
The PIK3CD variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patojenik 17
- Muhtemelen patojenik 12
| Varyant | Conditions | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1573G>A (p.Glu525Lys) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.3061G>A (p.Glu1021Lys) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.3074A>G (p.Glu1025Gly) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.241G>A (p.Glu81Lys) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.371G>A (p.Gly124Asp) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1002C>A (p.Asn334Lys) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1002C>G (p.Asn334Lys) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1246T>C (p.Cys416Arg) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1570T>A (p.Tyr524Asn) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1571A>C (p.Tyr524Ser) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1574A>G (p.Glu525Gly) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1574A>C (p.Glu525Ala) | immunodeficiency 14 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.104_105del (p.Pro35fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.157dup (p.Ala53fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.171_178del (p.Leu58fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.223C>T (p.Gln75Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.236_237del (p.Gln79fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.236dup (p.Gln80fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.494_512del (p.Tyr165fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.767dup (p.Cys257fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1306G>T (p.Glu436Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1314_1333del (p.Leu439fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1687C>T (p.Gln563Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.1708del (p.Ser570fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_005026.5(PIK3CD):c.2164G>T (p.Glu722Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 14 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
See all 29 with every other PIK3CD variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Aynı durumlarla ilişkili genler
- PIK3R1phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 13 durumu paylaşıyor
- AICDAactivation induced cytidine deaminase2 durumu paylaşıyor
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 12 durumu paylaşıyor
- BCL10BCL10 immune signaling adaptor2 durumu paylaşıyor
- BCL11BBCL11 transcription factor B2 durumu paylaşıyor
- BLNKB cell linker2 durumu paylaşıyor
- BTKBruton tyrosine kinase2 durumu paylaşıyor
- C1QAcomplement C1q A chain2 durumu paylaşıyor
- C1QBcomplement C1q B chain2 durumu paylaşıyor
- C1QCcomplement C1q C chain2 durumu paylaşıyor
- C1Scomplement C1s2 durumu paylaşıyor
- C2complement C22 durumu paylaşıyor
PIK3CD ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, PIK3CD geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the immune system
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Recurrent ear infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Recurrent skin infections
- Skin rash
18 özellik daha göster
- Autoimmunity
- Bone infection
- Combined immunodeficiency
- Decreased specific antibody response to vaccination
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent aspiration pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent fungal infections
- Recurrent viral infections
- Chronic active EBV infection
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Persistent human papillomavirus infection
- Recurrent Candida infection
- Unusual molluscum contagiosum
- Disseminated cryptosporidium infection
- Pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Abnormality of head or neck
- Recurrent sinus disease
- Pink eye
- Sinus disease
- Abnormal facial shape
- Abnormality of the chin
- Baggy eyes
- Broad nasal tip
- Chronic oral thrush
16 özellik daha göster
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Agammaglobulinemia
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Increased circulating IgM concentration
- Chronic decreased circulating IgA concentration
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
Abnormality of the digestive system
- Candida esophagitis
- Chronic diarrhea
- Colitis
- Inflammation of the large intestine
- Diarrhea
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Intestinal lymphoid nodular hyperplasia
4 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-18 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.18-8b139e39.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). PIK3CD geni: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pik3cd
Dante Labs. PIK3CD geni: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pik3cd
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde