Gen
PIK3CD
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta
- HGNC 8977↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000171608↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 5293↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1p36.22
- Koordinater
- Kromosom 1: 9 651 731–9 729 114 (GRCh38)
- Eksoner
- 24 eksoner over 77,4 kb
- Protein
- 1 044 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant
- Også kjent som
- p110D
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000377346.9NM_005026.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pik3cd.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PIK3CD og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Aktivert PI3K-delta-syndrom (APDS)
- Aktivert PI3K-delta-syndromAutosomal dominant
Immunsvikt med lymfoproliferasjon forårsaket av en enkelt aktiverende endring i PIK3CD eller PIK3R1.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Handlingsnytte
En genetisk diagnose gir mulighet for målrettet behandling med leniolisib, en PI3K-delta-hemmer, sammen med immunglobulinerstatning og overvåking for lymfom.
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsviktsykdommer
- Medfødt immunsviktsykdom
Ett av 114 gener knyttet til den
Arvelige sykdommer i immunsystemet forårsaket av endringer i enkeltgener, som påvirker hvordan kroppen bekjemper infeksjoner eller regulerer betennelse.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Immunsviktsykdom
Ett av 170 gener knyttet til den
Sykdom der det finnes en mangel eller defekt i immunforsvarsmekanismene, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Handlingsnytte
HSCT ved SCID og alvorlige PID; immunglobulinerstatning (IVIG/SCIG) ved antistoffmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4- og LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
Slik er PIK3CD bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,4 kb av genets 77,4 kb, og 3 135 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PIK3CD
26
posisjoner i PIK3CD der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
2 av dem (7,7 %) ligger i regioner som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
- Segmental duplications (2 steder)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsekvensering dekker alle 77,4 kb av PIK3CD, inkludert introner, ikke bare de 5,4 kb med eksoner.
Varianter med egen side (12)
De PIK3CD-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.1002C>G | Ekson 8 | 9 717 608 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| C416R | c.1246T>C | Ekson 10 | 9 719 924 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E81K | c.241G>A | Ekson 4 | 9 715 640 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E525A | c.1574A>C | Ekson 13 | 9 720 794 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E525G | c.1574A>G | Ekson 13 | 9 720 794 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E525K | c.1573G>A | Ekson 13 | 9 720 793 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E1021K | c.3061G>A | Ekson 24 | 9 726 972 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| E1025G | c.3074A>G | Ekson 24 | 9 726 985 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| G124D | c.371G>A | Ekson 5 | 9 715 849 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| N334K | c.1002C>A | Ekson 8 | 9 717 608 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- PIK3R1phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1Deler 3 tilstander
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeler 2 tilstander
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 2 tilstander
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeler 2 tilstander
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 2 tilstander
- BLNKB cell linkerDeler 2 tilstander
- BTKBruton tyrosine kinaseDeler 2 tilstander
- C1QAcomplement C1q A chainDeler 2 tilstander
- C1QBcomplement C1q B chainDeler 2 tilstander
- C1QCcomplement C1q C chainDeler 2 tilstander
- C1Scomplement C1sDeler 2 tilstander
- C2complement C2Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til PIK3CD
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene PIK3CD kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the immune system
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Recurrent ear infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Recurrent skin infections
- Skin rash
Vis 18 egenskaper til
- Autoimmunity
- Bone infection
- Combined immunodeficiency
- Decreased specific antibody response to vaccination
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent aspiration pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent fungal infections
- Recurrent viral infections
- Chronic active EBV infection
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Persistent human papillomavirus infection
- Recurrent Candida infection
- Unusual molluscum contagiosum
- Disseminated cryptosporidium infection
- Pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Abnormality of head or neck
- Recurrent sinus disease
- Pink eye
- Sinus disease
- Abnormal facial shape
- Abnormality of the chin
- Baggy eyes
- Broad nasal tip
- Chronic oral thrush
Vis 16 egenskaper til
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Agammaglobulinemia
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Increased circulating IgM concentration
- Chronic decreased circulating IgA concentration
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
Abnormality of the digestive system
- Candida esophagitis
- Chronic diarrhea
- Colitis
- Inflammation of the large intestine
- Diarrhea
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Intestinal lymphoid nodular hyperplasia
Vis 4 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PIK3CD-genet: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pik3cd
Dante Labs. PIK3CD-genet: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pik3cd
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker