Gen
PIK3CD
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta
- HGNC 8977↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000171608↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 5293↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p36.22
- Souřadnice
- Chromozom 1: 9 651 731–9 729 114 (GRCh38)
- Exony
- 24 exonů na 77,4 kb
- Protein
- 1 044 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- p110D
- Transkript MANE Select
- ENST00000377346.9NM_005026.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PIK3CD i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Activated PI3K-Delta Syndrome (APDS)
- Activated PI3K-delta syndromeAutozomálně dominantní
Immunodeficiency with lymphoproliferation caused by a single activating change in PIK3CD or PIK3R1.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
A genetic diagnosis allows targeted treatment with leniolisib, a PI3K-delta inhibitor, alongside immunoglobulin replacement and lymphoma monitoring.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je PIK3CD uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,4 kb z 77,4 kb genu; 3 135 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PIK3CD
26
pozic v genu PIK3CD, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 2 (7,7 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Segmental duplications (2 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 77,4 kb genu PIK3CD, včetně intronů, nikoli jen 5,4 kb exonů.
Varianty se stránkou (12)
Varianty genu PIK3CD se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| c.1002C>G | Exon 8 | 9 717 608 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| C416R | c.1246T>C | Exon 10 | 9 719 924 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E81K | c.241G>A | Exon 4 | 9 715 640 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E525A | c.1574A>C | Exon 13 | 9 720 794 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E525G | c.1574A>G | Exon 13 | 9 720 794 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E525K | c.1573G>A | Exon 13 | 9 720 793 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E1021K | c.3061G>A | Exon 24 | 9 726 972 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E1025G | c.3074A>G | Exon 24 | 9 726 985 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| G124D | c.371G>A | Exon 5 | 9 715 849 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| N334K | c.1002C>A | Exon 8 | 9 717 608 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- PIK3R1phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1Sdílí 3 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 2 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 2 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 2 onemocnění
- C1QAcomplement C1q A chainSdílí 2 onemocnění
- C1QBcomplement C1q B chainSdílí 2 onemocnění
- C1QCcomplement C1q C chainSdílí 2 onemocnění
- C1Scomplement C1sSdílí 2 onemocnění
- C2complement C2Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s PIK3CD
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PIK3CD. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the immune system
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Recurrent ear infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Recurrent skin infections
- Skin rash
Zobrazit ještě 18 rysů
- Autoimmunity
- Bone infection
- Combined immunodeficiency
- Decreased specific antibody response to vaccination
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent aspiration pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent fungal infections
- Recurrent viral infections
- Chronic active EBV infection
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Persistent human papillomavirus infection
- Recurrent Candida infection
- Unusual molluscum contagiosum
- Disseminated cryptosporidium infection
- Pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Abnormality of head or neck
- Recurrent sinus disease
- Pink eye
- Sinus disease
- Abnormal facial shape
- Abnormality of the chin
- Baggy eyes
- Broad nasal tip
- Chronic oral thrush
Zobrazit ještě 16 rysů
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Agammaglobulinemia
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Increased circulating IgM concentration
- Chronic decreased circulating IgA concentration
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
Abnormality of the digestive system
- Candida esophagitis
- Chronic diarrhea
- Colitis
- Inflammation of the large intestine
- Diarrhea
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Intestinal lymphoid nodular hyperplasia
Zobrazit ještě 4 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PIK3CD: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pik3cd
Dante Labs. Gen PIK3CD: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pik3cd
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů