Gen
PIK3CD
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta
- HGNC 8977↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000171608↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 5293↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1p36.22
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 9.651.731–9.729.114 (GRCh38)
- Exons
- 24 exons over 77,4 kb
- Eiwit
- 1.044 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- p110D
- MANE Select-transcript
- ENST00000377346.9NM_005026.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pik3cd.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees PIK3CD en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geactiveerd PI3K-deltasyndroom (APDS)
- Geactiveerd PI3K-deltasyndroomAutosomaal dominant
Immunodeficiëntie met lymfoproliferatie, veroorzaakt door een enkele activerende verandering in PIK3CD of PIK3R1.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Actionability
Een genetische diagnose maakt gerichte behandeling mogelijk met leniolisib, een PI3K-deltaremmer, naast vervangingstherapie met immunoglobulinen en controle op lymfoom.
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Aangeboren immuundeficiëntie
Een van 114 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen van het immuunsysteem die worden veroorzaakt door veranderingen in één gen en die invloed hebben op hoe het lichaam infecties bestrijdt of ontstekingen reguleert.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Immuundeficiëntieziekte
Een van 170 genen die hiermee verband houden
Ziekte waarbij er een tekort of defect is in de mechanismen van de immuniteit, zowel cellulair als humoraal.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Actionability
HSCT bij SCID en ernstige PID's; immunoglobulinevervangende therapie (IVIG/SCIG) bij antilichaamdeficiënties; leniolisib (Joenja, FDA 2023) bij APDS; genetherapie bij ADA-SCID; abatacept bij CTLA4- of LRBA-deficiëntie; profylactische antibiotica; G-CSF bij CGD
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van PIK3CD
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 5,4 kb van de 77,4 kb van het gen; 3.135 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van PIK3CD
26
posities in PIK3CD waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
2 daarvan (7,7%) vallen in gebieden waar korte reads moeilijk zijn.
- Segmental duplications (2 locaties)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een whole genome dekt alle 77,4 kb van PIK3CD, inclusief intronen, en niet alleen de 5,4 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (12)
De PIK3CD-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.1002C>G | Exon 8 | 9.717.608 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| C416R | c.1246T>C | Exon 10 | 9.719.924 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E81K | c.241G>A | Exon 4 | 9.715.640 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E525A | c.1574A>C | Exon 13 | 9.720.794 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E525G | c.1574A>G | Exon 13 | 9.720.794 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E525K | c.1573G>A | Exon 13 | 9.720.793 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E1021K | c.3061G>A | Exon 24 | 9.726.972 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| E1025G | c.3074A>G | Exon 24 | 9.726.985 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G124D | c.371G>A | Exon 5 | 9.715.849 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| N334K | c.1002C>A | Exon 8 | 9.717.608 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- PIK3R1phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1Deelt 3 aandoeningen
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeelt 2 aandoeningen
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deelt 2 aandoeningen
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeelt 2 aandoeningen
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeelt 2 aandoeningen
- BLNKB cell linkerDeelt 2 aandoeningen
- BTKBruton tyrosine kinaseDeelt 2 aandoeningen
- C1QAcomplement C1q A chainDeelt 2 aandoeningen
- C1QBcomplement C1q B chainDeelt 2 aandoeningen
- C1QCcomplement C1q C chainDeelt 2 aandoeningen
- C1Scomplement C1sDeelt 2 aandoeningen
- C2complement C2Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan PIK3CD
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PIK3CD kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the immune system
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Recurrent ear infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Decreased immune function
- Recurrent infections
- Recurrent skin infections
- Skin rash
Toon 18 kenmerken meer
- Autoimmunity
- Bone infection
- Combined immunodeficiency
- Decreased specific antibody response to vaccination
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent aspiration pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent fungal infections
- Recurrent viral infections
- Chronic active EBV infection
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Persistent human papillomavirus infection
- Recurrent Candida infection
- Unusual molluscum contagiosum
- Disseminated cryptosporidium infection
- Pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Abnormality of head or neck
- Recurrent sinus disease
- Pink eye
- Sinus disease
- Abnormal facial shape
- Abnormality of the chin
- Baggy eyes
- Broad nasal tip
- Chronic oral thrush
Toon 16 kenmerken meer
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Agammaglobulinemia
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Increased circulating IgM concentration
- Chronic decreased circulating IgA concentration
- Decreased anti-CD3/28-induced T-cell proliferation
Abnormality of the digestive system
- Candida esophagitis
- Chronic diarrhea
- Colitis
- Inflammation of the large intestine
- Diarrhea
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Intestinal lymphoid nodular hyperplasia
Toon 4 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PIK3CD-gen: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/pik3cd
Dante Labs. PIK3CD-gen: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/pik3cd
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken