Geeni
WDR19
WD repeat domain 19
- HGNC 18340↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000157796↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 57728↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 4p14
- Koordinaatit
- Kromosomi 4: 39 182 529–39 285 810 (GRCh38)
- Eksonit
- 37 eksonia 103,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 342 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- Pwdmp, KIAA1638, FLJ23127, ORF26, DYF-2, Oseg6, IFT144, NPHP13, FAP66, CFAP66
- MANE Select -transkripti
- ENST00000399820.8NM_025132.4
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/wdr19.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue WDR19 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Ellis-van Crevelden oireyhtymä ja kraniokoktodermaalinen dysplasia
- Kraniokoktodermaalinen dysplasiaAutosomaalinen resessiivinen
Siliopatia, johon liittyy kallon muodon muutoksia, lyhyet raajat, harva hius ja hammaspoikkeavuuksia sekä riski etenevään munuaissairauteen.
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Munuaisten ja maksan säännöllistä seurantaa suositellaan.
Nefronoftiisi ja Senior-Løken-oireyhtymä
- Senior-Løken-oireyhtymäAutosomaalinen resessiivinen
Nefronoftiisin muoto, johon liittyy verkkokalvon rappeutuminen. Se voi aiheuttaa varhaisen näön heikkenemisen.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tieto ohjaa silmätutkimukseen munuaisten seurannan rinnalla.
- NefronoftiisiAutosomaalinen resessiivinen
Autosomaalisesti resessiivisesti periytyvä munuaissairaus, jonka aiheuttavat NPHP1-geenin ja muiden sileäsyyhystinen (ripsi) geenien variantit. Etenevä tubulointerstitiaalinen arpeutuminen johtaa munuaisten vajaatoimintaan, tyypillisesti elämän ensimmäisten kolmen vuosikymmenen aikana.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedon avulla munuaisten toimintaa voidaan seurata säännöllisesti, dialyysiin tai siirteeseen voidaan varautua ajoissa, ja sukulaisille voidaan tehdin kantajatestaus.
Oireyhtymäinen kallon luuttumisen ennenaikainen eteneminen
Sairauksia, joissa kallon ompelusaumojen varhainen sulkeutuminen esiintyy yhdessä muiden piirteiden kanssa. Näihin kuuluvat Apertin, Crouzonin, Pfeifferin, Muenken ja Saethre-Chotzenin oireyhtymä, joita aiheuttavat geenit, kuten FGFR2, FGFR3, FGFR1, TWIST1, TCF12 ja ERF.
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Varhainen diagnoosi mahdollistaa ajoissa tehtävän leikkauksen sekä pään kasvun, näön ja kuulon seurannan. Lievemmät muodot, kuten Muenken oireyhtymä, voivat jäädä tunnistamatta aikuisilla, mikä on merkityksellistä perheen suunnittelun kannalta.
WDR19-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,4 kb geenin 103,3 kb:stä; 4 029 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: WDR19
116
WDR19-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 103,3 kb geenistä WDR19, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CEP164centrosomal protein 164Yhteisiä sairauksia: 2
- IFT122intraflagellar transport 122Yhteisiä sairauksia: 2
- IFT43intraflagellar transport 43Yhteisiä sairauksia: 2
- IFT52intraflagellar transport 52Yhteisiä sairauksia: 2
- NPHP3nephrocystin 3Yhteisiä sairauksia: 2
- NPHP4nephrocystin 4Yhteisiä sairauksia: 2
- WDR35WD repeat domain 35Yhteisiä sairauksia: 2
- ADAMTS9ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9Yhteinen sairaus: 1
- ANKS6ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6Yhteinen sairaus: 1
- CEP83centrosomal protein 83Yhteinen sairaus: 1
- CYP26B1cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1Yhteinen sairaus: 1
- DCDC2doublecortin domain containing 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin WDR19 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita WDR19 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the genitourinary system
- Absent sperm axoneme central pair complex
- Absent sperm flagella
- Chronic tubulointerstitial nephritis
- Coiled sperm flagella
- Global glomerulosclerosis
- Glomerular subepithelial immune-complex deposits
- Glomerulonephritis
- Irregularly shaped sperm tail
Näytä 13 piirrettä lisää
- Male infertility
- Multilamellation of medullary peritubular capillary basement membranes
- Nephronophthisis
- Reduced progressive sperm motility
- Short sperm flagella
- Small kidneys
- Stage 5 chronic kidney disease
- Chronic kidney disease
- Early menopause
- Glomerular sclerosis
- Renal interstitial fibrosis
- Kidney damage
- Renal failure
Abnormality of limbs
- Acetabular spurs
- Broad outermost finger bone
- Broad shaft of long bone
- Broad wide portion of long bone
- Disproportionately short upper portion of limb
- Pes valgus
- Short fingers or toes
- Short foot
Näytä 12 piirrettä lisää
- Wide toe bones
- Abnormal shape of shaft of long bone
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Short outermost finger bone
- Smaller or shorter than typical limbs
- Finger syndactyly
- Webbed fingers
- Curvature of little finger
- Extra little finger
- Extra toe attached near the little toe
- Fused toes
- More than five fingers or toes on hands or feet
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). WDR19-geeni: WD repeat domain 19. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/wdr19
Dante Labs. WDR19-geeni: WD repeat domain 19 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/wdr19
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa