Geeni
NPHP4
nephrocystin 4
- HGNC 19104↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000131697↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 261734↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p36.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 5 862 811–5 992 425 (GRCh38)
- Eksonit
- 30 eksonia 129,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 426 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- SLSN4, KIAA0673, POC10
- MANE Select -transkripti
- ENST00000378156.9NM_015102.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue NPHP4 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Nefronoftiisi ja Senior-Løken-oireyhtymä
- Senior-Løken-oireyhtymäAutosomaalinen resessiivinen
Nefronoftiisin muoto, johon liittyy verkkokalvon rappeutuminen. Se voi aiheuttaa varhaisen näön heikkenemisen.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tieto ohjaa silmätutkimukseen munuaisten seurannan rinnalla.
- NefronoftiisiAutosomaalinen resessiivinen
Autosomaalisesti resessiivisesti periytyvä munuaissairaus, jonka aiheuttavat NPHP1-geenin ja muiden sileäsyyhystinen (ripsi) geenien variantit. Etenevä tubulointerstitiaalinen arpeutuminen johtaa munuaisten vajaatoimintaan, tyypillisesti elämän ensimmäisten kolmen vuosikymmenen aikana.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedon avulla munuaisten toimintaa voidaan seurata säännöllisesti, dialyysiin tai siirteeseen voidaan varautua ajoissa, ja sukulaisille voidaan tehdin kantajatestaus.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
NPHP4-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5 kb geenin 129,6 kb:stä; 4 281 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä NPHP4
141
NPHP4-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 129,6 kb geenistä NPHP4, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CEP164centrosomal protein 164Yhteisiä sairauksia: 2
- NPHP3nephrocystin 3Yhteisiä sairauksia: 2
- WDR19WD repeat domain 19Yhteisiä sairauksia: 2
- ADAMTS9ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9Yhteinen sairaus: 1
- ANKS6ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6Yhteinen sairaus: 1
- CEP83centrosomal protein 83Yhteinen sairaus: 1
- DCDC2doublecortin domain containing 2Yhteinen sairaus: 1
- GLIS2GLIS family zinc finger 2Yhteinen sairaus: 1
- IFT54intraflagellar transport 54Yhteinen sairaus: 1
- INVSinversinYhteinen sairaus: 1
- IQCB1IQ motif containing B1Yhteinen sairaus: 1
- MAPKBP1mitogen-activated protein kinase binding protein 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin NPHP4 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NPHP4 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Abnormal retinal pigmentation
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Visual impairment
- Progressive loss of vision
- Rod-cone dystrophy
- Clouding of the lens of the eye
- Lazy eye
- Marked vision impairment
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NPHP4-geeni: nephrocystin 4. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nphp4
Dante Labs. NPHP4-geeni: nephrocystin 4 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nphp4
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa