Genas
PRRT2
proline rich transmembrane protein 2
- HGNC 30500↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000167371↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 112476↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 16p11.2
- Koordinatės
- Chromosoma 16: 29 812 193–29 815 881 (GRCh38)
- Eksonai
- 4 eksonų per 3,7 kb
- Baltymas
- 340 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ25513, DKFZp547J199, IFITMD1, FICCA, DSPB3, PKC, EKD1
- Ankstesni simboliai
- ICCA, DYT10
- MANE Select transkriptas
- ENST00000358758.12NM_145239.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/prrt2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite PRRT2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Distonija, miotonija, paroksizminė diskinezija
- Su PRRT2 susijęs paroksizminis judesio sutrikimasAutosominis dominantinis
Trumpi nevalingų judesių priepuoliai, sukeliami staigaus judesio (paroksizminė kinezigeninė diskinezija), kartais kartu su kūdikystės traukuliais; paprastai gerai reaguoja į mažos dozės priešepilepsinius vaistus.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Paroksizminė diskinezijaAutosominis dominantinis
Paroksizminė diskinezija (PD) – reta, nevienalytė judesio sutrikimų grupė, pasireiškianti nevalingais anomaliais judesiais, kurie periodiškai pasikartoja ir trunka trumpai. PD apima paroksizminę kinezigeninę diskineziją (PKD), paroksizminę nekinezigeninę diskineziją (PNKD), paroksizminę su pratimais susijusią diskineziją (PED) ir PKD variantą – kūdikystės traukulius ir choreoatetozę (ICCA sindromas).
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Paveldima distonija
Bendras terminas, apimantis paveldimas distonijas, įskaitant DYT-TOR1A ankstyvos pradžios generalizuotą distoniją, DYT-THAP1, mioklonijos-distonijos (SGCE) ir su KMT2B susijusią distoniją.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Platesnės grupės
Epilepsija (pilnas tyrimas)
- Epilepsija
Susijusi su 171 genu
Smegenų sutrikimas, pasireiškiantis epizodais, kai neuronai nenormaliai intensyviai išsikrauna, dėl ko atsiranda trumpalaikiai jutimo ar judesio neurologinio funkcijos sutrikimo arba psichikos funkcijos sutrikimo epizodai. Šie epizodai gali būti susiję arba nesusiję su sąmonės netekimu ar traukuliais.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas PRRT2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,5 kb iš 3,7 kb geno; 1 023 šių bazių koduoja baltymą.
PRRT2 sekvenavimas
114
pozicijų gene PRRT2, kuriose ClinVar pakitimą priskiria patogeniniam arba tikriausiai patogeniniam
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomas apima visus 3,7 kb geno PRRT2, įskaitant intronus, o ne tik 2,5 kb eksonų.
ClinVar pathogenic variants (137)
The PRRT2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeninis 109
- Patogeninis / tikriausiai patogeninis 2
- Tikriausiai patogeninis 26
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NM_145239.3(PRRT2):c.629dup (p.Ala211fs) (opens in a new tab) | PRRT2-associated paroxysmal movement disorder and 3 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.649dup (p.Arg217fs) (opens in a new tab) | epilepsy and 5 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.649del (p.Arg217fs) (opens in a new tab) | PRRT2-associated paroxysmal movement disorder and 6 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.649C>T (p.Arg217Ter) (opens in a new tab) | PRRT2-associated paroxysmal movement disorder and 3 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.718C>T (p.Arg240Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.748C>T (p.Gln250Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia 1 and 2 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.971del (p.Gly324fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia and 3 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.955G>T (p.Val319Leu) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia and 1 other | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_145239.3(PRRT2):c.-65-1G>A (opens in a new tab) | seizures, benign familial infantile, 2 | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.27dup (p.Glu10Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.49_50del (p.Pro18fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia 1 | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.55A>T (p.Lys19Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.106del (p.Gln36fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.121del (p.Val41fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.130C>T (p.Gln44Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.189del (p.Lys64fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.210_211del (p.Glu70fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.219_220del (p.Glu73fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.224dup (p.Ala76fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.247C>T (p.Gln83Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.268dup (p.Ser90fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.280G>T (p.Glu94Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.282_283insC (p.Ser95fs) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.284C>A (p.Ser95Ter) (opens in a new tab) | infantile convulsions and choreoathetosis and 1 other | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
| NM_145239.3(PRRT2):c.284C>G (p.Ser95Ter) (opens in a new tab) | episodic kinesigenic dyskinesia | Patogeninis | ★★★★1 žvaigždutė iš 4 kriterijai pateikti, vienas pateikėjas |
See all 137 with every other PRRT2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- SLC2A1solute carrier family 2 member 1Turi 3 bendrų būklių
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Turi 2 bendrų būklių
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Turi 2 bendrų būklių
- PNKDPNKD metallo-beta-lactamase domain containingTuri 2 bendrų būklių
- PNKPpolynucleotide kinase 3'-phosphataseTuri 2 bendrų būklių
- TMEM151Atransmembrane protein 151ATuri 2 bendrų būklių
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Turi 1 bendrą būklę
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ACTBactin betaTuri 1 bendrą būklę
- ACTL6Bactin like 6BTuri 1 bendrą būklę
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Turi 1 bendrą būklę
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su PRRT2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PRRT2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Paroxysmal dystonia
- Abnormal speech pattern
- Chorea
- Choreoathetosis
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- EEG abnormality
- Focal motor seizure
Rodyti dar 82 savybių
- Focal sensory seizure
- Generalized-onset seizure
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Migraine with aura
- Neonatal seizure
- Normal interictal EEG
- Paroxysmal dyskinesia
- Balance impairment
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brief seizures with staring spells
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal clonic seizure
- Focal impaired awareness autonomic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Hyperactive movements
- Intellectual disability
- Paroxysmal choreoathetosis
- Pins and needles feeling
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Torsion dystonia
- Weakness of one side of body
- Aggressive behavior
- Alien limb phenomenon
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
- Cognitive impairment
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty finding words
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with spike-wave complexes
- Experiential epileptic aura
- Eyelid myoclonia seizure
- Focal head nodding automatism seizure
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Impaired temperature sensation
- Incoordination
- Infantile spasms
- Irritability
- Language impairment
- Limb myoclonus
- Loss of developmental milestones
- Migraine
- Neonatal electro-clinical seizure with behavior arrest
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Specific learning disability
- Spontaneous pain sensation
- Sudden loss of muscle tone
- Writer's cramp
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- EEG with focal sharp waves
- Intellectual disability, mild
- Interictal epileptiform activity
- Obsessive-compulsive trait
- Repeated seizures without recovery between them
- Simple febrile seizure
- Slow movements
- Tremor
- Brain imaging abnormality
- Orofacial dyskinesia
- Psychomotor deterioration
Abnormality of the eye
- Blind spot
- Double vision
- Metamorphopsia
- Photopsia
- Gaze-evoked horizontal nystagmus
- Seesaw nystagmus
- Staring gaze
- Vertical nystagmus
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-18: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-8b139e39.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PRRT2 genas: proline rich transmembrane protein 2. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/prrt2
Dante Labs. PRRT2 genas: proline rich transmembrane protein 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/prrt2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites