Geen
NDP
norrin cystine knot growth factor NDP
- HGNC 7678↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000124479↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 4693↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xp11.3
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 43 948 776–43 973 390 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 24,6 kb
- Valk
- 133 aminohapet
- Pärilikkus
- X-seotud retsessiivne
- Tuntud ka kui
- norrin
- Varasemad tähised
- EVR2
- MANE Select transkript
- ENST00000642620.1NM_000266.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe NDP ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Vitreoretinopatia
- Norrie tõbiX-seotud retsessiivne
Haruldane X-kromosoomiga seotud pärilik vitreoretinaalne haigus, mida iseloomustab ebanormaalne võrkkesta areng ja kaasasündinud pimedus. Sagedased kaasnevad ilmingud on sensorineuraalne kuulmislangus ja arengu viivitus, intellektipuue ja/või käitumishäired.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Vitreoretinaalne degeneratsioon
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- X-seotud retsessiivne
- Muutus on X-kromosoomis, seega mõjutab üks koopia isaseid, kellel on üks X-kromosoom, samas kui ühe koopiaga emased on tavaliselt kandjad. Kandjast ema annab selle igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas NDP on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,7 kb kogupikkusega 24,6 kb; neist 402 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse NDP
23
kohad geenis NDP, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni NDP 24,6 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,7 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- BEST1bestrophin 1Jagab 1 haigust
- CAPN5calpain 5Jagab 1 haigust
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainJagab 1 haigust
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainJagab 1 haigust
- CTNNB1catenin beta 1Jagab 1 haigust
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Jagab 1 haigust
- FZD4frizzled class receptor 4Jagab 1 haigust
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Jagab 1 haigust
Geeniga NDP seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida NDP võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the eye
- Corneal opacity
- Decreased clarity of vision
- Remnants of the hyaloid vascular system
- Retinal detachment
- Shallow anterior chamber
- Vitreoretinopathy
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormally close eyes
Näita veel 52 tunnust
- Abnormally small eyeball
- Anterior chamber synechiae
- Blindness
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Deeply set eye
- Eye tumor
- Hardening of skin and connective tissue
- Leukocoria
- Retinopathy of prematurity
- Underdeveloped iris
- Abnormal macular morphology
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal vitreous humor morphology
- Absent/small lens
- Angle closure glaucoma
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Enlarged eyeball
- Falciform retinal fold
- Glaucoma
- Glial remnants anterior to the optic disc
- Hyaloid vascular remnant and retrolental mass
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Persistent pupillary membrane
- Retinal fold
- Subretinal fluid
- Tractional retinal detachment
- Abnormal anterior chamber morphology
- Abnormality of the pupil
- Absent/small iris
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Ectopia lentis
- Epiretinal membrane
- Eye floaters
- Increased tears
- Lazy eye
- Macular edema
- Macular hypoplasia
- Marked vision impairment
- Optic atrophy
- Phthisis bulbi
- Retinal hole
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Severe near sightedness
- Exudative vitreoretinopathy
- Intraretinal exudate
- Opacification of the corneal stroma
- Peripheral vitreous opacities
- Retinal dysplasia
- Subretinal exudate
Abnormality of the nervous system
- Anxiety
- Intellectual disability
- Irritability
- Psychosis
- Repetitive movements
- Abnormal diencephalon morphology
- Absent/small cerebellum
- Attention deficit
Näita veel 17 tunnust
- Autism
- Behavioral abnormality
- Clonus
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Hallucinations
- Increased reflexes
- Intellectual disability, mild
- Loss of developmental milestones
- Migraine
- Mild global developmental delay
- Motor delay
- Self-injurious behavior
- Aggressive behavior
- Dementia
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). NDP geen: norrin cystine knot growth factor NDP. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ndp
Dante Labs. NDP geen: norrin cystine knot growth factor NDP [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ndp
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast