Gen
SMARCA2
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2
- HGNC 11098↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000080503↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6595↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 9p24.3
- Souřadnice
- Chromozom 9: 2 015 347–2 193 620 (GRCh38)
- Exony
- 34 exonů na 178,3 kb
- Protein
- 1 590 aminokyselin
- Další názvy
- BAF190, hSNF2a, hBRM, Sth1p, SNF2LA, BRM, SNF2, SWI2
- Předchozí symboly
- SNF2L2
- Transkript MANE Select
- ENST00000349721.8NM_003070.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SMARCA2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je SMARCA2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,7 kb z 178,3 kb genu; 4 773 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SMARCA2
59
pozic v genu SMARCA2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 178,3 kb genu SMARCA2, včetně intronů, nikoli jen 5,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADKadenosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxSdílí 1 onemocnění
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Sdílí 1 onemocnění
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Sdílí 1 onemocnění
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ANK3ankyrin 3Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SMARCA2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SMARCA2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Eye folds
- Narrow opening between the eyelids
- Triangular face
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Decreased volume of lip
- Drooping lower lip
- Full lower lip
Zobrazit ještě 46 rysů
- High, narrow palate
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Smooth philtrum
- Sparse scalp hair
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide mouth
- Bulbous nose
- Curly eyelashes
- Dimple chin
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- Flat face
- Frontal bossing
- Highly arched eyebrow
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Low hairline at back of neck
- Low hanging columella
- Narrow eyelid opening
- Narrow nasal bridge
- Short lingual frenulum
- Short nose
- Short opening between the eyelids
- Skin tag in front of the ear
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Sparse medial eyebrow
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide nasal bridge
- Widely spaced teeth
- Wrinkles around the eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Bad bite
- Decreased size of tooth
- Monobrow
- Narrow nasal ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Thin dental enamel
- Wide nose
- Absent eyebrow
- Unequal size of opening between the eyelids
- Wide nasal base
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Difficulty finding words
- Echoing another person's speech
- Inability to speak
- Specific learning disability
- Aggressive behavior
Zobrazit ještě 18 rysů
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Epileptic spasm
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Short attention span
- Autism spectrum disorder
- Chiari malformation
- Hypoplasia of the pons
- Low frustration tolerance
- Overfriendliness
- Repetitive movements
- Thin corpus callosum
- Absent speech development
- Poor speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Joint dislocation
- Delayed bone maturation
- Enlarged joints
- Flexed joint that cannot be straightened
- Low muscle tone
- Scoliosis
- Abnormal formation of the hip
- Abnormal shape of end part of bone
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the integument
- Hair loss
- Sparse hair
- Abnormal hair pattern
- Absent/small toenails
- Birthmark
- Dry hair
- Excessive hair growth
- Excessive wrinkled skin
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SMARCA2: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/smarca2
Dante Labs. Gen SMARCA2: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/smarca2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů