Gen
SMARCA2
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2
- HGNC 11098↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000080503↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6595↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 9p24.3
- Koordinater
- Kromosom 9: 2 015 347–2 193 620 (GRCh38)
- Eksoner
- 34 eksoner over 178,3 kb
- Protein
- 1 590 aminosyrer
- Også kjent som
- BAF190, hSNF2a, hBRM, Sth1p, SNF2LA, BRM, SNF2, SWI2
- Tidligere symboler
- SNF2L2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000349721.8NM_003070.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les SMARCA2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Intellektuell funksjonsnedsettelse
Ett av 233 gener knyttet til den
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er SMARCA2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,7 kb av genets 178,3 kb, og 4 773 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test SMARCA2
59
posisjoner i SMARCA2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 178,3 kb av SMARCA2, inkludert introner, og ikke bare de 5,7 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 tilstand
- ADKadenosine kinaseDeler 1 tilstand
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 tilstand
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 tilstand
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 tilstand
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 tilstand
- ANK3ankyrin 3Deler 1 tilstand
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 tilstand
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 tilstand
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til SMARCA2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene SMARCA2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of head or neck
- Eye folds
- Narrow opening between the eyelids
- Triangular face
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Decreased volume of lip
- Drooping lower lip
- Full lower lip
Vis 46 egenskaper til
- High, narrow palate
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Smooth philtrum
- Sparse scalp hair
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide mouth
- Bulbous nose
- Curly eyelashes
- Dimple chin
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- Flat face
- Frontal bossing
- Highly arched eyebrow
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Low hairline at back of neck
- Low hanging columella
- Narrow eyelid opening
- Narrow nasal bridge
- Short lingual frenulum
- Short nose
- Short opening between the eyelids
- Skin tag in front of the ear
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Sparse medial eyebrow
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide nasal bridge
- Widely spaced teeth
- Wrinkles around the eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Bad bite
- Decreased size of tooth
- Monobrow
- Narrow nasal ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Thin dental enamel
- Wide nose
- Absent eyebrow
- Unequal size of opening between the eyelids
- Wide nasal base
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Difficulty finding words
- Echoing another person's speech
- Inability to speak
- Specific learning disability
- Aggressive behavior
Vis 18 egenskaper til
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Epileptic spasm
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Short attention span
- Autism spectrum disorder
- Chiari malformation
- Hypoplasia of the pons
- Low frustration tolerance
- Overfriendliness
- Repetitive movements
- Thin corpus callosum
- Absent speech development
- Poor speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Joint dislocation
- Delayed bone maturation
- Enlarged joints
- Flexed joint that cannot be straightened
- Low muscle tone
- Scoliosis
- Abnormal formation of the hip
- Abnormal shape of end part of bone
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of the integument
- Hair loss
- Sparse hair
- Abnormal hair pattern
- Absent/small toenails
- Birthmark
- Dry hair
- Excessive hair growth
- Excessive wrinkled skin
Vis 2 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SMARCA2-genet: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/smarca2
Dante Labs. SMARCA2-genet: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/smarca2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker