Gen
SMARCA2
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2
- HGNC 11098↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000080503↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6595↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 9p24.3
- Koordinater
- Kromosom 9: 2 015 347–2 193 620 (GRCh38)
- Exoner
- 34 exoner på 178,3 kb
- Protein
- 1 590 aminosyror
- Även känd som
- BAF190, hSNF2a, hBRM, Sth1p, SNF2LA, BRM, SNF2, SWI2
- Tidigare symboler
- SNF2L2
- MANE Select-transkript
- ENST00000349721.8NM_003070.5
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/smarca2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SMARCA2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Intellektuell funktionsnedsättning
En av 233 gener kopplade till den
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SMARCA2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5,7 kb av genens 178,3 kb, och 4 773 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SMARCA2
59
positioner i SMARCA2 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 178,3 kb av SMARCA2, inklusive introner, och inte bara de 5,7 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Delar 1 tillstånd
- ADKadenosine kinaseDelar 1 tillstånd
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDelar 1 tillstånd
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Delar 1 tillstånd
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Delar 1 tillstånd
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ANK3ankyrin 3Delar 1 tillstånd
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Delar 1 tillstånd
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Delar 1 tillstånd
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SMARCA2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SMARCA2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Eye folds
- Narrow opening between the eyelids
- Triangular face
- Abnormally small head
- Broad philtrum
- Decreased volume of lip
- Drooping lower lip
- Full lower lip
Visa ytterligare 46 egenskaper
- High, narrow palate
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Smooth philtrum
- Sparse scalp hair
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide mouth
- Bulbous nose
- Curly eyelashes
- Dimple chin
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- Flat face
- Frontal bossing
- Highly arched eyebrow
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Low hairline at back of neck
- Low hanging columella
- Narrow eyelid opening
- Narrow nasal bridge
- Short lingual frenulum
- Short nose
- Short opening between the eyelids
- Skin tag in front of the ear
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Sparse medial eyebrow
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide nasal bridge
- Widely spaced teeth
- Wrinkles around the eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Bad bite
- Decreased size of tooth
- Monobrow
- Narrow nasal ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Thin dental enamel
- Wide nose
- Absent eyebrow
- Unequal size of opening between the eyelids
- Wide nasal base
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Difficulty finding words
- Echoing another person's speech
- Inability to speak
- Specific learning disability
- Aggressive behavior
Visa ytterligare 18 egenskaper
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Epileptic spasm
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Short attention span
- Autism spectrum disorder
- Chiari malformation
- Hypoplasia of the pons
- Low frustration tolerance
- Overfriendliness
- Repetitive movements
- Thin corpus callosum
- Absent speech development
- Poor speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Joint dislocation
- Delayed bone maturation
- Enlarged joints
- Flexed joint that cannot be straightened
- Low muscle tone
- Scoliosis
- Abnormal formation of the hip
- Abnormal shape of end part of bone
Visa ytterligare 3 egenskaper
Abnormality of the integument
- Hair loss
- Sparse hair
- Abnormal hair pattern
- Absent/small toenails
- Birthmark
- Dry hair
- Excessive hair growth
- Excessive wrinkled skin
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SMARCA2-genen: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/smarca2
Dante Labs. SMARCA2-genen: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/smarca2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor