Gen
GATA6
GATA binding protein 6
- HGNC 4174↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000141448↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 2627↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 18q11.2
- Souřadnice
- Chromozom 18: 22 169 589–22 202 528 (GRCh38)
- Exony
- 7 exonů na 32,9 kb
- Protein
- 595 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Transkript MANE Select
- ENST00000269216.10NM_005257.6
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si GATA6 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Diabetes Mellitus
A metabolic disorder characterized by abnormally high blood sugar levels due to diminished production of insulin or insulin resistance/desensitization.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Teplizumab (Tzield) for stage 2 presymptomatic T1D (FDA approved 2022); insulin replacement at clinical T1D onset; TrialNet autoantibody screening for high-risk relatives; closed-loop insulin delivery systems
Inherited Congenital Heart Defects
- GATA6-Related Congenital Heart DiseaseAutozomálně dominantní
Congenital heart defects caused by changes in GATA6, often with an underdeveloped pancreas or diabetes.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing about it supports checks for diabetes and pancreatic function alongside heart care.
- Pancreatic Hypoplasia, Diabetes and Congenital Heart Disease SyndromeAutozomálně dominantní
A condition, usually caused by changes in GATA6, that combines an underdeveloped pancreas, diabetes and congenital heart defects.
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Atrial Septal Defect
A hole between the upper chambers of the heart; inherited forms are caused by genes such as NKX2-5, GATA4, TBX20, MYH6 and ACTC1, and NKX2-5 forms also carry a risk of progressive heart block.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing about it supports heart imaging and, for NKX2-5, regular ECG checks.
Neonatal Diabetes Mellitus
Diabetes diagnosed in the first months of life, either permanent or transient, caused by single-gene defects in insulin production or secretion.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Most people with KCNJ11 or ABCC8 neonatal diabetes can switch from insulin injections to sulfonylurea tablets, often with better glucose control.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je GATA6 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,6 kb z 32,9 kb genu; 1 788 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte GATA6
31
pozic v genu GATA6, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 32,9 kb genu GATA6, včetně intronů, nikoli jen 3,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- GATA4GATA binding protein 4Sdílí 4 onemocnění
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Sdílí 2 onemocnění
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinSdílí 2 onemocnění
- EIF2B1eukaryotic translation initiation factor 2B subunit alphaSdílí 2 onemocnění
- GCKglucokinaseSdílí 2 onemocnění
- GLIS3GLIS family zinc finger 3Sdílí 2 onemocnění
- HNF1BHNF1 homeobox BSdílí 2 onemocnění
- IL2RAinterleukin 2 receptor subunit alphaSdílí 2 onemocnění
- INSinsulinSdílí 2 onemocnění
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Sdílí 2 onemocnění
- MNX1motor neuron and pancreas homeobox 1Sdílí 2 onemocnění
- NEUROD1neuronal differentiation 1Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s GATA6
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit GATA6. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- Hole in center of heart
- Muscular ventricular septal defect
- Underdeveloped left heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Left-to-right shunt
- Patent foramen ovale
- Abnormal cardiovascular system morphology
Zobrazit ještě 42 rysů
- Fainting spell
- Palpitations
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right atrial enlargement
- Secundum atrial septal defect
- Systolic heart murmur
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal heart rate
- Abnormal left ventricular function
- Abnormal mitral valve morphology
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Atrial flutter
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Double outlet left ventricle
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Hypoplastic tricuspid valve
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Interrupted aortic arch
- Mitral regurgitation
- Narrowing of lung artery
- Narrowing of pulmonic valve
- Patent ductus arteriosus
- Perimembranous ventricular septal defect
- Right ventricular dilatation
- Small right heart chamber
- ST segment depression
- Supraventricular arrhythmia
- Supraventricular tachycardia
- Total absence of the pericardium
- Transposition of the great arteries
- Tricuspid regurgitation
- Truncus arteriosus
- Congenital defect of the pericardium
- Increased pulmonary vascular resistance
- Mini stroke
- Right ventricular failure
- Stroke
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- Narrowing of aorta
Abnormality of the digestive system
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Absent pancreas
- Feeding difficulties
- Intermittent diarrhea
- Intestinal malrotation
- Underdeveloped pancreas
- Absent gallbladder
- Biliary atresia
Zobrazit ještě 5 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen GATA6: GATA binding protein 6. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/gata6
Dante Labs. Gen GATA6: GATA binding protein 6 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/gata6
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů