Gen
GATA6
GATA binding protein 6
- HGNC 4174↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000141448↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 2627↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 18q11.2
- Coördinaten
- Chromosoom 18: 22.169.589–22.202.528 (GRCh38)
- Exons
- 7 exons over 32,9 kb
- Eiwit
- 595 aminozuren
- MANE Select-transcript
- ENST00000269216.10NM_005257.6
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gata6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees GATA6 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Diabetes mellitus
Een stofwisselingsstoornis die wordt gekenmerkt door abnormaal hoge bloedsuikerspiegels als gevolg van verminderde insulineproductie of insulineresistentie/-ongevoeligheid.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Teplizumab (Tzield) voor presymptomatisch T1D in stadium 2 (door de FDA goedgekeurd in 2022); insulinevervanging bij klinisch begin van T1D; TrialNet-screening op autoantilichamen bij risicovolle familieleden; closed-loop-systemen voor insulinetoediening
Erfelijke aangeboren hartafwijkingen
- Aangeboren hartziekte gerelateerd aan GATA6Autosomaal dominant
Aangeboren hartafwijkingen veroorzaakt door veranderingen in GATA6, vaak samen met een onderontwikkelde alvleesklier of diabetes.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u dit weet, helpt dat bij controles op diabetes en alvleesklierfunctie naast de zorg voor het hart.
- Syndroom van alvleesklierhypoplasie, diabetes en aangeboren hartziekteAutosomaal dominant
Een aandoening, meestal veroorzaakt door veranderingen in GATA6, waarbij een onderontwikkelde alvleesklier, diabetes en aangeboren hartafwijkingen samengaan.
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Atriumseptumdefect
Een gat tussen de boven hartkamers; erfelijke vormen worden veroorzaakt door genen zoals NKX2-5, GATA4, TBX20, MYH6 en ACTC1, en vormen door NKX2-5 brengen ook een risico op progressief hartblok met zich mee.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u dit weet, helpt dat bij hartonderzoek met beeldvorming en, bij NKX2-5, bij regelmatige ECG-controles.
Neonatale diabetes mellitus
Diabetes die in de eerste maanden van het leven wordt vastgesteld, blijvend of tijdelijk, veroorzaakt door defecten in één gen die de aanmaak of afgifte van insuline verstoren.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
De meeste mensen met neonatale diabetes door KCNJ11- of ABCC8-varianten kunnen overstappen van insulineinjecties naar sulfonylureumtabletten, vaak met een betere glucoseregulatie.
Opbouw van GATA6
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,6 kb van de 32,9 kb van het gen; 1.788 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van GATA6
31
posities in GATA6 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 32,9 kb van GATA6, inclusief intronen, en niet alleen de 3,6 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- GATA4GATA binding protein 4Deelt 4 aandoeningen
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Deelt 2 aandoeningen
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinDeelt 2 aandoeningen
- EIF2B1eukaryotic translation initiation factor 2B subunit alphaDeelt 2 aandoeningen
- GCKglucokinaseDeelt 2 aandoeningen
- GLIS3GLIS family zinc finger 3Deelt 2 aandoeningen
- HNF1BHNF1 homeobox BDeelt 2 aandoeningen
- IL2RAinterleukin 2 receptor subunit alphaDeelt 2 aandoeningen
- INSinsulinDeelt 2 aandoeningen
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Deelt 2 aandoeningen
- MNX1motor neuron and pancreas homeobox 1Deelt 2 aandoeningen
- NEUROD1neuronal differentiation 1Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan GATA6
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die GATA6 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the cardiovascular system
- Hole in center of heart
- Muscular ventricular septal defect
- Underdeveloped left heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Left-to-right shunt
- Patent foramen ovale
- Abnormal cardiovascular system morphology
Toon 42 kenmerken meer
- Fainting spell
- Palpitations
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right atrial enlargement
- Secundum atrial septal defect
- Systolic heart murmur
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal heart rate
- Abnormal left ventricular function
- Abnormal mitral valve morphology
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Atrial flutter
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Double outlet left ventricle
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Hypoplastic tricuspid valve
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Interrupted aortic arch
- Mitral regurgitation
- Narrowing of lung artery
- Narrowing of pulmonic valve
- Patent ductus arteriosus
- Perimembranous ventricular septal defect
- Right ventricular dilatation
- Small right heart chamber
- ST segment depression
- Supraventricular arrhythmia
- Supraventricular tachycardia
- Total absence of the pericardium
- Transposition of the great arteries
- Tricuspid regurgitation
- Truncus arteriosus
- Congenital defect of the pericardium
- Increased pulmonary vascular resistance
- Mini stroke
- Right ventricular failure
- Stroke
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- Narrowing of aorta
Abnormality of the digestive system
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Absent pancreas
- Feeding difficulties
- Intermittent diarrhea
- Intestinal malrotation
- Underdeveloped pancreas
- Absent gallbladder
- Biliary atresia
Toon 5 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). GATA6-gen: GATA binding protein 6. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/gata6
Dante Labs. GATA6-gen: GATA binding protein 6 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/gata6
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken