Gen
LHX4
LIM homeobox 4
- HGNC 21734↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000121454↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 89884↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 1q25.2
- Koordinatlar
- Kromozom 1: 180.230.264–180.278.984 (GRCh38)
- Eksonlar
- 48,7 kb boyunca 6 ekson
- Protein
- 390 amino asit
- Diğer adları
- Gsh4
- MANE Select transkripti
- ENST00000263726.4NM_033343.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/lhx4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLHX4 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hipogonadotropik Hipogonadizm
Hipotalamus-hipofiz ekseninden yeterli hormonal uyarı alınamaması nedeniyle yumurtalık veya testis fonksiyonunun bozulmasıdır.
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Edinilmemiş Kombine Hipofiz Hormon Eksikliği
- Genetik kökenli kombine hipofiz hormon yetmezliği
PROP1, POU1F1, HESX1 ve ilgili nedenleri de içeren, birden fazla hipofiz hormonunun kalıtsal yetmezliği.
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Konjenital hipopitüitarizm, hipofiz ontogenezinde rol oynayan hipofiz transkripsiyon faktörlerindeki mutasyonlara bağlı olarak; somatotrof, tirotrof, laktotrof, kortikotrof veya gonadotrof eksiklikleri dahil olmak üzere birden fazla hipofiz hormonunun eksikliği ile karakterizedir.
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
LHX4 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 48,7 kb uzunluğunun 5,8 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.173 tanesi proteini kodlar.
LHX4 dizilemesi
0Düşük
100 üzerinden, LHX4 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, LHX4 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%2,5
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%0,1
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
2
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin LHX4 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, LHX4 genin tamamı olan 48,7 kb'yi kapsar; yalnızca 5,8 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- LHX3LIM homeobox 33 durumu paylaşıyor
- FOXA2forkhead box A22 durumu paylaşıyor
- GH1growth hormone 12 durumu paylaşıyor
- GHRHRgrowth hormone releasing hormone receptor2 durumu paylaşıyor
- HESX1HESX homeobox 12 durumu paylaşıyor
- OTX2orthodenticle homeobox 22 durumu paylaşıyor
- POU1F1POU class 1 homeobox 12 durumu paylaşıyor
- PROP1PROP paired-like homeobox 12 durumu paylaşıyor
- RBM28RNA binding motif protein 282 durumu paylaşıyor
- RNPC3RNA binding region (RNP1, RRM) containing 32 durumu paylaşıyor
- ROBO1roundabout guidance receptor 12 durumu paylaşıyor
- SOX3SRY-box transcription factor 32 durumu paylaşıyor
LHX4 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, LHX4 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the endocrine system
- Ectopic posterior pituitary
- Hypopituitarism
- Abnormality of the hypothalamus-pituitary axis
- Decreased thyroid-stimulating hormone level
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Reduced radioactive iodine uptake
- Abnormal prolactin level
- Absent pituitary gland
19 özellik daha göster
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating T4 concentration
- Decreased response to growth hormone stimulation test
- Delayed puberty
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Panhypopituitarism
- Reduced circulating prolactin concentration
- Small thyroid gland
- Underactive thyroid
- Underdeveloped pituitary gland
- Absence of secondary sex characteristics
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Diabetes insipidus
- Inappropriate antidiuretic hormone secretion
- Small adrenal glands
- Ectopic anterior pituitary gland
- Adrenal insufficiency
- Impaired growth-hormone response to insulin stimulation test
Abnormality of head or neck
- Small hypophyseal fossa
- Abnormally large tongue
- Delayed cranial suture closure
- Facial puffiness
- Flat nose
- Large posterior fontanelle
- Abnormal facial shape
- Depressed nasal bridge
4 özellik daha göster
Abnormality of the nervous system
- Decreased reflex response
- Lethargy
- Neurodevelopmental delay
- Abnormality of the cerebellum
- Agenesis of corpus callosum
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
3 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). LHX4 geni: LIM homeobox 4. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lhx4
Dante Labs. LHX4 geni: LIM homeobox 4 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/lhx4
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde