Gen
SDHAF2
succinate dehydrogenase complex assembly factor 2
- HGNC 26034↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000167985↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 54949↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q12.2
- Koordinater
- Kromosom 11: 61 430 124–61 446 733 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 16,6 kb
- Protein
- 166 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- FLJ20487, SDH5
- Tidigare symboler
- PGL2, C11orf79
- MANE Select-transkript
- ENST00000301761.7NM_017841.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SDHAF2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ärftligt feokromocytom och paragangliom
- Ärftligt feokromocytom–paragangliomAutosomalt dominant
En grupp syndrom (PPGL typ 1–7, TMEM127- och MAX-relaterade) där varianter i SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX eller TMEM127 ökar risken för feokromocytom och paragangliom.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Vad kunskapen förändrar
Regelbundna blod- eller urinprov för metanefriner och periodisk MR av hela kroppen hjälper till att hitta tumörer tidigt, innan de orsakar blodtryckskriser. Släktingar kan erbjudas testning.
Malign endokrin neoplasi
En malign neoplasi som drabbar de endokrina körtlarna. Typiska exempel är karcinom i sköldkörteln, bisköldkörteln, hypofysen och binjurebarken.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Tumör i urinvägar och njurar
- Neoplasm i urinvägarna
En godartad eller elakartad, primär eller metastaserande neoplasm som omfattar urinvägarna.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är SDHAF2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,2 kb av genens 16,6 kb, och 501 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SDHAF2
59
positioner i SDHAF2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 16,6 kb av SDHAF2, med introner inräknade, inte bara de 1,2 kb exoner.
Varianter med egen sida (14)
De SDHAF2-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.37-1G>C | Intron 1 | 61 437 624 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.260+1G>A | Intron 2 | 61 437 849 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| c.371-2A>G | Intron 3 | 61 445 939 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| F89Lfs*9 | c.267del | Exon 3 | 61 438 005 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| G78R | c.232G>A | Exon 2 | 61 437 820 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| N103Efs*4 | c.305_306insA | Exon 3 | 61 438 048 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| Q56X | c.166C>T | Exon 2 | 61 437 754 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| R77Gfs*10 | c.229_230del | Exon 2 | 61 437 814 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| S4Lfs*31 | c.9_19del | Exon 1 | 61 430 152 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| S8X | c.23C>A | Exon 1 | 61 430 169 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
Gener kopplade till samma tillstånd
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ADelar 3 tillstånd
- RETret proto-oncogeneDelar 2 tillstånd
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BDelar 2 tillstånd
- TP53tumor protein p53Delar 2 tillstånd
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Delar 1 tillstånd
- CDC73cell division cycle 73Delar 1 tillstånd
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Delar 1 tillstånd
- FLCNfolliculinDelar 1 tillstånd
- MAXMYC associated transcriptional regulator XDelar 1 tillstånd
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseDelar 1 tillstånd
- PAX6paired box 6Delar 1 tillstånd
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SDHAF2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SDHAF2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SDHAF2-genen: succinate dehydrogenase complex assembly factor 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sdhaf2
Dante Labs. SDHAF2-genen: succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sdhaf2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor