Genă
PHGDH
phosphoglycerate dehydrogenase
- HGNC 8923↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000092621↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 26227↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 1p12
- Coordonate
- Cromozomul 1: 119.711.934–119.744.215 (GRCh38)
- Exoni
- 12 de exoni pe 32,3 kb
- Proteină
- 533 de aminoacizi
- Mod de transmitere
- Autozomal recesivă
- Denumiri alternative
- SERA, PGDH, PDG
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000641023.2NM_006623.4
- Tip de locus
- gene with protein product
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Genom de referințăGRCh38hg38
Pozițiile de pe paginile genelor și variantelor urmează această alegere, în acest browser.
Citiți PHGDH și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Tulburările metabolismului glicinei și serinei
- Tulburări de deficit de serinăAutozomal recesivă
Cauzate de variante ale genelor PHGDH, PSAT1 sau PSPH, care blochează producerea serinei și pot provoca micro-cefalie, convulsii și întârziere în dezvoltare.
- ClinGen evaluează legătura drept definitivă
- 5 de evaluatori GenCC o clasifică drept definitivă sau puternică
Ce schimbă cunoașterea
Cunoașterea acestei afecțiuni permite suplimentarea cu serină și glicină, care pot preveni sau ameliora simptomele dacă sunt începute devreme, inclusiv înainte de naștere.
Mod de transmitere
- Autozomal recesivă
- Este nevoie de câte o copie modificată de la fiecare părinte. Cu una singură, sunteți purtător și, de regulă, nu sunteți afectat; când ambii părinți sunt purtători, fiecare copil are o șansă de unu la patru de a moșteni două copii.
Structura genei PHGDH
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 1,9 kb din cei 32,3 kb ai genei; 1.602 dintre aceste baze codifică proteina.
Cum citește un test genomic PHGDH
135
poziții în PHGDH în care ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un test genomic complet acoperă toți cei 32,3 kb ai genei PHGDH, inclusiv intronii, nu doar cei 1,9 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
Trăsături asociate cu PHGDH
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca PHGDH. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Brain degeneration
- Ventriculomegaly
- Cerebral hypomyelination
- Cerebral white matter atrophy
- Delayed myelination
- Developmental stagnation
- Epileptic spasm
- Severe global developmental delay
Afișați încă 23 de trăsături
- Abnormal cortical gyration
- Behavioral abnormality
- Brief seizures with staring spells
- Focal emotional seizure with laughing
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Inappropriate crying
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Irritability
- Moderate global developmental delay
- Small cerebrum
- Sudden loss of muscle tone
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Agenesis of corpus callosum
- Cerebral dysmyelination
- Choroid plexus cyst
- Epilepsy
- Fewer or absent grooves in brain
- Hydranencephaly
- Hypsarrhythmia
- Intellectual disability
- Small cerebellum
- Split spine
Abnormality of limbs
- Long fingers
- Rocker bottom foot
- Inward turned thumb
- Curvature of digit
- Finger syndactyly
- Foot and ankle bend up toward shin of leg
- Fused toes
- Joint contracture of the hand
Afișați încă 3 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, publicate în 2026-10-16: de care afecțiuni este legată gena și cât de puternică este legătura.
- Lista ACMG de descoperiri secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena PHGDH: phosphoglycerate dehydrogenase. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/phgdh
Dante Labs. Gena PHGDH: phosphoglycerate dehydrogenase [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/phgdh
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni