Gen
PHGDH
phosphoglycerate dehydrogenase
- HGNC 8923↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000092621↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 26227↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1p12
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 119.711.934–119.744.215 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 32,3 kb
- Eiwit
- 533 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal recessief
- Ook bekend als
- SERA, PGDH, PDG
- MANE Select-transcript
- ENST00000641023.2NM_006623.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees PHGDH en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke stoornissen van glycine- en serinestofwisseling
- SerinedeficiëntiestoornissenAutosomaal recessief
Veroorzaakt door varianten in PHGDH, PSAT1 of PSPH, die de aanmaak van serine blokkeren en kunnen leiden tot een kleine hoofdomtrek, epileptische aanvallen en vertraagde ontwikkeling.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Met deze kennis kan serine- en glycinesuppletie worden toegepast, die symptomen kan voorkomen of verbeteren wanneer ze vroeg wordt gestart, ook al vóór de geboorte.
Overerving
- Autosomaal recessief
- Er is een veranderde kopie van elke ouder nodig. Met één bent u drager en meestal niet aangedaan. Wanneer beide ouders dragers zijn, heeft elk kind een kans van één op vier om er twee te erven.
Opbouw van PHGDH
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,9 kb van de 32,3 kb van het gen; 1.602 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest PHGDH leest
135
posities in PHGDH waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 32,3 kb van PHGDH, inclusief introns, en niet alleen de 1,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan PHGDH
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PHGDH kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Brain degeneration
- Ventriculomegaly
- Cerebral hypomyelination
- Cerebral white matter atrophy
- Delayed myelination
- Developmental stagnation
- Epileptic spasm
- Severe global developmental delay
Toon 23 kenmerken meer
- Abnormal cortical gyration
- Behavioral abnormality
- Brief seizures with staring spells
- Focal emotional seizure with laughing
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Inappropriate crying
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Irritability
- Moderate global developmental delay
- Small cerebrum
- Sudden loss of muscle tone
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Agenesis of corpus callosum
- Cerebral dysmyelination
- Choroid plexus cyst
- Epilepsy
- Fewer or absent grooves in brain
- Hydranencephaly
- Hypsarrhythmia
- Intellectual disability
- Small cerebellum
- Split spine
Abnormality of limbs
- Long fingers
- Rocker bottom foot
- Inward turned thumb
- Curvature of digit
- Finger syndactyly
- Foot and ankle bend up toward shin of leg
- Fused toes
- Joint contracture of the hand
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PHGDH-gen: phosphoglycerate dehydrogenase. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/phgdh
Dante Labs. PHGDH-gen: phosphoglycerate dehydrogenase [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/phgdh
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken