Gene
ALPK3
alpha kinase 3
- HGNC 17574↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000136383↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 57538↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 15q25.3
- Coordenadas
- Cromossoma 15: 84 817 356–84 873 479 (GRCh38)
- Exões
- 14 exões ao longo de 56,1 kb
- Proteína
- 1705 aminoácidos
- Também conhecido como
- MAK, KIAA1330, Midori
- Transcrito MANE Select
- ENST00000258888.6NM_020778.5
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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page$gene$nameAnalise ALPK3, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Obter o meu Genome TestRelatório com curadoria relevante para este gene
Miocardiopatia Hipertrófica
- Autossómica dominante
Um de 62 genes ligados a este
Doença em que o miocárdio está hipertrofiado sem uma causa evidente. A hipertrofia é, em geral, assimétrica e pode estar associada à obstrução da via de saída ventricular.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Betabloqueantes, bloqueadores dos canais de cálcio não di-hidropiridínicos, restrição da atividade física, aconselhamento genético
Como ALPK3 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 10,2 kb dos 56,1 kb do gene; 5118 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de ALPK3
2Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar ALPK3 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de ALPK3 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.1,4%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.20%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
83
posições em ALPK3 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região difícil de analisar com leituras curtas.
Um genoma completo abrange os 56,1 kb de ALPK3, incluindo os intrões, e não apenas os 10,2 kb de exões.
Genes associados às mesmas condições
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainPartilha 1 condição
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Partilha 1 condição
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinasePartilha 1 condição
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CPartilha 1 condição
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Partilha 1 condição
- DHHdesert hedgehog signaling moleculePartilha 1 condição
- DHX37DEAH-box helicase 37Partilha 1 condição
- DMPKDM1 protein kinasePartilha 1 condição
- ERFETS2 repressor factorPartilha 1 condição
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaPartilha 1 condição
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaPartilha 1 condição
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenasePartilha 1 condição
Características associadas a ALPK3
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que ALPK3 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the cardiovascular system
- Concentric hypertrophic cardiomyopathy
- Enlarged and thickened heart muscle
- Enlarged heart
- Impaired myocardial contractility
- Left atrial enlargement
- Left ventricular diastolic dysfunction
- Left ventricular dilatation
- Left ventricular hypertrophy
Mostrar mais 24 características
- Mildly reduced left ventricular ejection fraction
- Mitral regurgitation
- Moderately reduced left ventricular ejection fraction
- Patent foramen ovale
- Persistent left superior vena cava
- Right atrial enlargement
- Right ventricular dilatation
- Severely reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Stroke
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular septal hypertrophy
- Right ventricular hypertrophy
- Biventricular hypertrophy
- Prolonged QTc interval
- Extra heart beat
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Prolonged PR interval
- Prolonged QRS complex
- Second degree atrioventricular block
- Shortened PR interval
- Sinus bradycardia
- Sinus tachycardia
- Ventricular fibrillation
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal arthrogryposis
- Elbow contracture
- Funnel chest
- Missing part of vertebrae
- Stiff knee
- Central core regions in muscle fibers
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone
Mostrar mais 3 características
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Full cheeks
- Long philtrum
- Submucous cleft palate
- Webbed neck
- Cystic hygroma
- High palate
- Little lower jaw
Mostrar mais 1 característica
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-17: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.17-8666dff2.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene ALPK3: alpha kinase 3. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/alpk3
Dante Labs. Gene ALPK3: alpha kinase 3 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/alpk3
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