Gen
ALPK3
alpha kinase 3
- HGNC 17574↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000136383↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 57538↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 15q25.3
- Koordinater
- Kromosom 15: 84 817 356–84 873 479 (GRCh38)
- Eksoner
- 14 eksoner over 56,1 kb
- Protein
- 1 705 aminosyrer
- Også kjent som
- MAK, KIAA1330, Midori
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000258888.6NM_020778.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alpk3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes ALPK3 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Hypertrofisk kardiomyopati
- Autosomal dominant
Ett av 62 gener knyttet til den
En tilstand der hjertemuskelen er forstørret uten en åpenbar årsak. Forstørrelsen er vanligvis asymmetrisk og kan være assosiert med obstruksjon av utløpsveien fra hjertekammeret.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Betablokkere, ikke-dihydropyridin-kalsiumkanalblokkere, begrensning av aktivitet, genetisk veiledning
Slik er ALPK3 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 10,2 kb av genets 56,1 kb, og 5 118 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av ALPK3
83
posisjoner i ALPK3 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 56,1 kb av ALPK3, inkludert introner, ikke bare de 10,2 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (85)
The ALPK3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 32
- Patogen/sannsynligvis patogen 4
- Sannsynligvis patogen 49
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_020778.5(ALPK3):c.61_62delinsT (p.Gly21fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.3175C>T (p.Arg1059Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.297del (p.Ile99fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.663_664delinsG (p.Phe221fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 1 other | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.3726del (p.Lys1243fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy and 2 others | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.4234C>T (p.Arg1412Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.3535del (p.Glu1179fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.4768C>T (p.Arg1590Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_020778.5(ALPK3):c.208C>T (p.Gln70Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.412C>T (p.Gln138Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.423del (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.589G>T (p.Glu197Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.607G>T (p.Glu203Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.691C>T (p.Gln231Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.835G>T (p.Glu279Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.913C>T (p.Gln305Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1036_1039dup (p.Pro347fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1093C>T (p.Gln365Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1337_1340del (p.Pro446fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1445_1446del (p.Arg482fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1626del (p.Gln543fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.1642_1645dup (p.Pro549fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.2237del (p.Gly746fs) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.2260G>T (p.Glu754Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_020778.5(ALPK3):c.2455C>T (p.Arg819Ter) (opens in a new tab) | cardiomyopathy, familial hypertrophic 27 | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
See all 85 with every other ALPK3 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainDeler 1 tilstand
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Deler 1 tilstand
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeler 1 tilstand
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CDeler 1 tilstand
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Deler 1 tilstand
- DHHdesert hedgehog signaling moleculeDeler 1 tilstand
- DHX37DEAH-box helicase 37Deler 1 tilstand
- DMPKDM1 protein kinaseDeler 1 tilstand
- ERFETS2 repressor factorDeler 1 tilstand
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaDeler 1 tilstand
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaDeler 1 tilstand
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til ALPK3
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ALPK3 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Concentric hypertrophic cardiomyopathy
- Enlarged and thickened heart muscle
- Enlarged heart
- Impaired myocardial contractility
- Left atrial enlargement
- Left ventricular diastolic dysfunction
- Left ventricular dilatation
- Left ventricular hypertrophy
Vis 24 egenskaper til
- Mildly reduced left ventricular ejection fraction
- Mitral regurgitation
- Moderately reduced left ventricular ejection fraction
- Patent foramen ovale
- Persistent left superior vena cava
- Right atrial enlargement
- Right ventricular dilatation
- Severely reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Stroke
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular septal hypertrophy
- Right ventricular hypertrophy
- Biventricular hypertrophy
- Prolonged QTc interval
- Extra heart beat
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Prolonged PR interval
- Prolonged QRS complex
- Second degree atrioventricular block
- Shortened PR interval
- Sinus bradycardia
- Sinus tachycardia
- Ventricular fibrillation
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal arthrogryposis
- Elbow contracture
- Funnel chest
- Missing part of vertebrae
- Stiff knee
- Central core regions in muscle fibers
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Full cheeks
- Long philtrum
- Submucous cleft palate
- Webbed neck
- Cystic hygroma
- High palate
- Little lower jaw
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-8b139e39.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ALPK3-genet: alpha kinase 3. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/alpk3
Dante Labs. ALPK3-genet: alpha kinase 3 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/alpk3
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker