Gén
BRCA1
BRCA1 DNA repair associated
- HGNC 1100↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000012048↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 672↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 17q21.31
- Koordináták
- 17. kromoszóma: 43 044 295–43 125 364 (GRCh38)
- Exonok
- 23 exon, összesen 81,1 kb
- Fehérje
- 1863 aminosav
- Más néven ismert
- RNF53, BRCC1, PPP1R53, FANCS
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000357654.9NM_007294.4
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/brca1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a BRCA1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
DNA Repair Disease
- Autoszomális recesszív
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Fanconi Anemia
- Autoszomális recesszív
Fanconi anemia (FA) is a hereditary DNA repair disorder characterized by progressive pancytopenia with bone marrow failure, variable congenital malformations and predisposition to develop hematological or solid tumors.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Hematopoietic stem cell transplantation using FA-specific reduced-intensity conditioning; androgens (oxymetholone) as bridge therapy; cancer surveillance for head/neck and gynecological malignancies; gene therapy in clinical trials
Hereditary Breast and Ovarian Cancer (BRCA1/2)
- BRCA1-related cancer predispositionAutoszomális domináns
BRCA1 variants that raise the lifetime risk of breast, ovarian and other cancers.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
▶Beavatkozhatóság
Enhanced breast screening including MRI, consideration of risk-reducing surgery, and testing of relatives.
- Hereditary Breast and Ovarian Cancer SyndromeAutoszomális domináns
A cancer predisposition syndrome, most often due to BRCA1 or BRCA2 variants, with high lifetime risks of breast and ovarian cancer.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
▶Beavatkozhatóság
Genetic counseling, enhanced screening, risk-reducing surgery
A BRCA1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 81,1 kb-jából 7,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5592 bázis kódolja a fehérjét.
BRCA1 szekvenálása
2680
BRCA1-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 52 (1,9%) olyan régiókba esnek, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
- Segmental duplications (52 pozíció)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genomszekvenálás a BRCA1 gén mind a 81,1 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 7,1 kb-át.
Oldallal rendelkező variánsok (2450)
Az itt található, oldallal rendelkező BRCA1 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A92Ffs*4 | c.273_274del | 5. exon | 43 104 894 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A134Qfs*7 | c.399_400del | 6. exon | 43 104 162 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A302Cfs*2 | c.903_904insT | 10. exon | 43 094 627 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A302Lfs*12 | c.904del | 10. exon | 43 094 626 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A322Kfs*2 | c.964_968del | 10. exon | 43 094 562 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A322Lfs*19 | c.964del | 10. exon | 43 094 566 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A407Sfs*5 | c.1218_1219insA | 10. exon | 43 094 312 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A433Pfs*8 | c.1297del | 10. exon | 43 094 233 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A469Qfs*6 | c.1405del | 10. exon | 43 094 125 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A521X | c.1561_1564delinsTAAA | 10. exon | 43 093 967 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- BRCA2BRCA2 DNA repair associated3 betegséget oszt meg
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 12 betegséget oszt meg
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit2 betegséget oszt meg
- FANCAFA complementation group A2 betegséget oszt meg
- FANCBFA complementation group B2 betegséget oszt meg
- FANCCFA complementation group C2 betegséget oszt meg
- FANCD2FA complementation group D22 betegséget oszt meg
- FANCEFA complementation group E2 betegséget oszt meg
- FANCFFA complementation group F2 betegséget oszt meg
- FANCGFA complementation group G2 betegséget oszt meg
- FANCIFA complementation group I2 betegséget oszt meg
- FANCLFA complementation group L2 betegséget oszt meg
A(z) BRCA1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) BRCA1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal bloating
- Abdominal pain
- Anorexia
- Biliary tract neoplasm
- Constipation
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Jaundice
Még 19 tulajdonság megjelenítése
- Nausea and vomiting
- Peritonitis
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
- Intestinal pseudo-obstruction
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Coarse facial features
- Low frontal hairline
- Prominent nasal bridge
- Underdeveloped tissue around nostril
- Almond shaped eyes
- Short opening between the eyelids
- Abnormality of the eyelid
Még 18 tulajdonság megjelenítése
- Aplasia/Hypoplasia of the uvula
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft palate
- Eye folds
- Facial asymmetry
- Frontal bossing
- High palate
- Little lower jaw
- Long, narrow head
- Sloping forehead
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Bad bite
- Full upper lip
- Increased size of tooth
- Long eyelashes
- Narrow opening between the eyelids
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
Abnormality of the eye
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Abnormally small eyeball
- Absent/small iris
- Astigmatism
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Swollen lymph nodes
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). BRCA1 gén: BRCA1 DNA repair associated. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/brca1
Dante Labs. BRCA1 gén: BRCA1 DNA repair associated [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/brca1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt