Geeni
BRCA1
BRCA1 DNA repair associated
- HGNC 1100↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000012048↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 672↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 17q21.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 17: 43 044 295–43 125 364 (GRCh38)
- Eksonit
- 23 eksonia 81,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 863 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- RNF53, BRCC1, PPP1R53, FANCS
- MANE Select -transkripti
- ENST00000357654.9NM_007294.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue BRCA1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
DNA-korjausmekanismin häiriöön liittyvä sairaus
- Autosomaalinen resessiivinen
Sairaus, jonka taustalla on DNA:n korjausmekanismien häiriö.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Fanconin anemia
- Autosomaalinen resessiivinen
Fanconin anemia (FA) on perinnöllinen DNA:n korjaushäiriö, jolle on ominaista etenevä pansytopenia luuytimen vajaatoiminnan vuoksi, vaihtelevat synnynnäiset epämuodostumat ja alttius kehittää veri- tai kiinteitä kasvaimia.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Hematopoieettisten kantasolujen siirto FA-spesifisellä vähennetyn intensiteetin valmistelulla; androgeenit (oksimetolone) siltahoitona; syöpäseuranta pään ja kaulan sekä gynekologisten syöpien varalta; geenihoito kliinisissä tutkimuksissa
Perinnöllinen rinta- ja munasarjasyöpä (BRCA1/2)
- BRCA1-liittyvä syöpäalttiusAutosomaalinen dominantti
BRCA1-variantit, jotka suurentavat rintasyövän, munasarjasyövän ja muiden syöpien riskiä elinaikana.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Tehostettu rintojen seulonta, mukaan lukien MRI-tutkimus, riskiä pienentävän leikkauksen harkinta sekä sukulaisten testaaminen.
- Perinnöllinen rinta- ja munasarjasyöpäoireyhtymäAutosomaalinen dominantti
Syöpäalttiusoireyhtymä, joka useimmiten johtuu BRCA1- tai BRCA2-variantista ja johon liittyy suuri elinaikainen riski sairastua rinta- ja munasarjasyöpään.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Geneettinen neuvonta, tehostettu seulonta, riskiä vähentävä leikkaus
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
BRCA1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,1 kb geenin 81,1 kb:stä; 5 592 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä BRCA1
2 680
BRCA1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 52 (1,9 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Segmental duplications (52 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 81,1 kb geenistä BRCA1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 7,1 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (2450)
Tässä ovat BRCA1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A92Ffs*4 | c.273_274del | Eksoni 5 | 43 104 894 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A134Qfs*7 | c.399_400del | Eksoni 6 | 43 104 162 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A302Cfs*2 | c.903_904insT | Eksoni 10 | 43 094 627 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A302Lfs*12 | c.904del | Eksoni 10 | 43 094 626 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A322Kfs*2 | c.964_968del | Eksoni 10 | 43 094 562 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A322Lfs*19 | c.964del | Eksoni 10 | 43 094 566 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A407Sfs*5 | c.1218_1219insA | Eksoni 10 | 43 094 312 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A433Pfs*8 | c.1297del | Eksoni 10 | 43 094 233 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A469Qfs*6 | c.1405del | Eksoni 10 | 43 094 125 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A521X | c.1561_1564delinsTAAA | Eksoni 10 | 43 093 967 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedYhteisiä sairauksia: 3
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitYhteisiä sairauksia: 2
- FANCAFA complementation group AYhteisiä sairauksia: 2
- FANCBFA complementation group BYhteisiä sairauksia: 2
- FANCCFA complementation group CYhteisiä sairauksia: 2
- FANCD2FA complementation group D2Yhteisiä sairauksia: 2
- FANCEFA complementation group EYhteisiä sairauksia: 2
- FANCFFA complementation group FYhteisiä sairauksia: 2
- FANCGFA complementation group GYhteisiä sairauksia: 2
- FANCIFA complementation group IYhteisiä sairauksia: 2
- FANCLFA complementation group LYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin BRCA1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita BRCA1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal bloating
- Abdominal pain
- Anorexia
- Biliary tract neoplasm
- Constipation
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Jaundice
Näytä 19 piirrettä lisää
- Nausea and vomiting
- Peritonitis
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
- Intestinal pseudo-obstruction
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Coarse facial features
- Low frontal hairline
- Prominent nasal bridge
- Underdeveloped tissue around nostril
- Almond shaped eyes
- Short opening between the eyelids
- Abnormality of the eyelid
Näytä 18 piirrettä lisää
- Aplasia/Hypoplasia of the uvula
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft palate
- Eye folds
- Facial asymmetry
- Frontal bossing
- High palate
- Little lower jaw
- Long, narrow head
- Sloping forehead
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Bad bite
- Full upper lip
- Increased size of tooth
- Long eyelashes
- Narrow opening between the eyelids
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Swollen lymph nodes
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). BRCA1-geeni: BRCA1 DNA repair associated. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/brca1
Dante Labs. BRCA1-geeni: BRCA1 DNA repair associated [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/brca1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa