Gén
FANCI
FA complementation group I
- HGNC 25568↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000140525↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 55215↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 15q26.1
- Koordináták
- 15. kromoszóma: 89 243 979–89 317 131 (GRCh38)
- Exonok
- 38 exon, összesen 73,2 kb
- Fehérje
- 1328 aminosav
- Más néven ismert
- FLJ10719
- Korábbi jelölések
- KIAA1794
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000310775.12NM_001113378.2
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fanci.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a FANCI-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
DNA Repair Disease
- Autoszomális recesszív
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Fanconi Anemia
- Autoszomális recesszív
Fanconi anemia (FA) is a hereditary DNA repair disorder characterized by progressive pancytopenia with bone marrow failure, variable congenital malformations and predisposition to develop hematological or solid tumors.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Hematopoietic stem cell transplantation using FA-specific reduced-intensity conditioning; androgens (oxymetholone) as bridge therapy; cancer surveillance for head/neck and gynecological malignancies; gene therapy in clinical trials
A FANCI felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 73,2 kb-jából 4,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3987 bázis kódolja a fehérjét.
FANCI szekvenálása
1Könnyű
Mennyire nehéz a FANCI rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A FANCI exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a FANCI exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.2%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.0,7%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a FANCI exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
246
a FANCI azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a FANCI mind a 73,2 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 4,7 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (275)
The FANCI variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 117
- Patogén/valószínűleg patogén 13
- Valószínűleg patogén 145
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001113378.2(FANCI):c.1461T>A (p.Tyr487Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.1840C>T (p.Arg614Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3493del (p.Asp1165fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3623dup (p.Cys1209fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3853C>T (p.Arg1285Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3895C>T (p.Arg1299Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.158-2A>G (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.295del (p.His99fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.446del (opens in a new tab) | Fanconi anemia complementation group I | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.849T>A (p.Tyr283Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.1597C>T (p.Arg533Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.2345_2346del (p.Leu781_Ser782insTer) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.2422A>T (p.Lys808Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.2509G>T (p.Glu837Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.2568_2569del (p.Gly857fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.2737C>T (p.Gln913Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia complementation group I | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3041G>A (p.Cys1014Tyr) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3622_3623del (p.Leu1208fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.3626_3627del (p.Cys1209fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.238dup (p.Asp80fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.834del (p.Ile279fs) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.886G>T (p.Gly296Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.998C>A (p.Ser333Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.1246C>T (p.Gln416Ter) (opens in a new tab) | Fanconi anemia complementation group I | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001113378.2(FANCI):c.1512+1G>A (opens in a new tab) | Fanconi anemia | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
See all 275 with every other FANCI variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- BRCA1BRCA1 DNA repair associated2 betegséget oszt meg
- BRCA2BRCA2 DNA repair associated2 betegséget oszt meg
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 12 betegséget oszt meg
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit2 betegséget oszt meg
- FANCAFA complementation group A2 betegséget oszt meg
- FANCBFA complementation group B2 betegséget oszt meg
- FANCCFA complementation group C2 betegséget oszt meg
- FANCD2FA complementation group D22 betegséget oszt meg
- FANCEFA complementation group E2 betegséget oszt meg
- FANCFFA complementation group F2 betegséget oszt meg
- FANCGFA complementation group G2 betegséget oszt meg
- FANCLFA complementation group L2 betegséget oszt meg
A(z) FANCI génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) FANCI gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the cardiovascular system
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Abnormal cardiac septum morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Patent ductus arteriosus
- Patent foramen ovale
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal cardiovascular system morphology
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Chiari malformation
- Colpocephaly
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Cranial nerve paralysis
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). FANCI gén: FA complementation group I. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fanci
Dante Labs. FANCI gén: FA complementation group I [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fanci
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt