Geeni
SOX9
SRY-box transcription factor 9
- HGNC 11204↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000125398↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6662↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 17q24.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 17: 72 121 020–72 126 416 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 5,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 509 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SRA1
- Aiemmat symbolit
- CMD1, CMPD1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000245479.3NM_000346.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SOX9 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SOX9. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
SOX9-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,9 kb geenin 5,4 kb:stä; 1 530 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SOX9
59
SOX9-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 5,4 kb geenistä SOX9, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,9 kb eksoneja.
Geeniin SOX9 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SOX9 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the genitourinary system
- Absent sperm in semen
- Hypospadias
- Infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Sex reversal
- Abnormal internal genitalia
- Abnormal labia morphology
- Abnormal male internal genitalia morphology
Näytä 38 piirrettä lisää
- Abnormal morphology of female internal genitalia
- Abnormal scrotal rugation
- Abnormal scrotum morphology
- Abnormal sex determination
- Abnormal vagina morphology
- Abnormality of the uterus
- Ambiguous external genitalia
- Cleft of scrotum
- Decreased fertility
- Decreased fertility in females
- Decreased testicular size
- Dysplastic testis
- Enlarged clitoris
- Female external genitalia in individual with 46,XY karyotype
- Gonadal dysgenesis
- Male infertility
- Male pseudohermaphroditism
- Ovotestis
- Polycystic ovaries
- Primary amenorrhea
- Short penis
- Smaller than typical growth of scrotum
- Streak ovary
- True hermaphroditism
- Underdeveloped penis
- Underdeveloped vagina
- Undescended testes
- Urogenital sinus anomaly
- Vanishing testis
- Gonadoblastoma
- Perineal hypospadias
- Hydronephrosis
- Ovarian gonadoblastoma
- Testicular gonadoblastoma
- Nephroblastoma
- Nephrotic syndrome
- Dysgerminoma
- Small uterus
Abnormality of head or neck
- Depressed nasal bridge
- Little lower jaw
- Midface retrusion
- Big calvaria
- Cleft palate
- Flat face
- Retraction of the tongue
- Short neck
Näytä 18 piirrettä lisää
- Relatively large head
- Abnormality of the sense of smell
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Dental cavities
- Eye folds
- Frontal bossing
- High palate
- Irregular teeth
- Long philtrum
- Narrow mouth
- Recurrent colds
- Submucous cleft hard palate
- Flat nose
- High forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Short opening between the eyelids
- Small face
- Wider-than-typical soft spot of skull
Abnormality of the musculoskeletal system
- Cervical spine instability
- Rounded neck
- 11 pairs of ribs
- Hypoplastic inferior ilia
- Narrow chest
- Osteoporosis
- Poorly ossified cervical vertebrae
- Recurrent fractures
Näytä 18 piirrettä lisää
- Scoliosis
- Short long bone
- Small abnormally formed shoulder blade
- Kyphoscoliosis
- Small shoulder blade
- Delayed bone maturation
- Delayed maturation of end part of long bone
- Double-Jointed
- Hunched back
- Low muscle tone
- Narrow iliac wing
- Pigeon chest
- Thoracic scoliosis
- Absent bone maturation in sternum
- Hypoplastic cervical vertebrae
- Hypoplastic iliac wing
- Small chest
- Thin ribs
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hypoplasia of olfactory tract
- Mild global developmental delay
- Moderate global developmental delay
- Pauses in breathing while sleeping
- Spinal dysraphism
- Split spine
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SOX9-geeni: SRY-box transcription factor 9. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/sox9
Dante Labs. SOX9-geeni: SRY-box transcription factor 9 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/sox9
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa