Geen
SOX9
SRY-box transcription factor 9
- HGNC 11204↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000125398↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6662↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17q24.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 72 121 020–72 126 416 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 5,4 kb
- Valk
- 509 aminohapet
- Tuntud ka kui
- SRA1
- Varasemad tähised
- CMD1, CMPD1
- MANE Select transkript
- ENST00000245479.3NM_000346.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SOX9 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SOX9 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas SOX9 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,9 kb kogupikkusega 5,4 kb; neist 1530 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SOX9
59
kohad geenis SOX9, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SOX9 5,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,9 kb).
Geeniga SOX9 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SOX9 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the genitourinary system
- Absent sperm in semen
- Hypospadias
- Infertility
- Non-obstructive azoospermia
- Sex reversal
- Abnormal internal genitalia
- Abnormal labia morphology
- Abnormal male internal genitalia morphology
Näita veel 38 tunnust
- Abnormal morphology of female internal genitalia
- Abnormal scrotal rugation
- Abnormal scrotum morphology
- Abnormal sex determination
- Abnormal vagina morphology
- Abnormality of the uterus
- Ambiguous external genitalia
- Cleft of scrotum
- Decreased fertility
- Decreased fertility in females
- Decreased testicular size
- Dysplastic testis
- Enlarged clitoris
- Female external genitalia in individual with 46,XY karyotype
- Gonadal dysgenesis
- Male infertility
- Male pseudohermaphroditism
- Ovotestis
- Polycystic ovaries
- Primary amenorrhea
- Short penis
- Smaller than typical growth of scrotum
- Streak ovary
- True hermaphroditism
- Underdeveloped penis
- Underdeveloped vagina
- Undescended testes
- Urogenital sinus anomaly
- Vanishing testis
- Gonadoblastoma
- Perineal hypospadias
- Hydronephrosis
- Ovarian gonadoblastoma
- Testicular gonadoblastoma
- Nephroblastoma
- Nephrotic syndrome
- Dysgerminoma
- Small uterus
Abnormality of head or neck
- Depressed nasal bridge
- Little lower jaw
- Midface retrusion
- Big calvaria
- Cleft palate
- Flat face
- Retraction of the tongue
- Short neck
Näita veel 18 tunnust
- Relatively large head
- Abnormality of the sense of smell
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Dental cavities
- Eye folds
- Frontal bossing
- High palate
- Irregular teeth
- Long philtrum
- Narrow mouth
- Recurrent colds
- Submucous cleft hard palate
- Flat nose
- High forehead
- Narrow opening between the eyelids
- Short opening between the eyelids
- Small face
- Wider-than-typical soft spot of skull
Abnormality of the musculoskeletal system
- Cervical spine instability
- Rounded neck
- 11 pairs of ribs
- Hypoplastic inferior ilia
- Narrow chest
- Osteoporosis
- Poorly ossified cervical vertebrae
- Recurrent fractures
Näita veel 18 tunnust
- Scoliosis
- Short long bone
- Small abnormally formed shoulder blade
- Kyphoscoliosis
- Small shoulder blade
- Delayed bone maturation
- Delayed maturation of end part of long bone
- Double-Jointed
- Hunched back
- Low muscle tone
- Narrow iliac wing
- Pigeon chest
- Thoracic scoliosis
- Absent bone maturation in sternum
- Hypoplastic cervical vertebrae
- Hypoplastic iliac wing
- Small chest
- Thin ribs
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hypoplasia of olfactory tract
- Mild global developmental delay
- Moderate global developmental delay
- Pauses in breathing while sleeping
- Spinal dysraphism
- Split spine
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SOX9 geen: SRY-box transcription factor 9. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/sox9
Dante Labs. SOX9 geen: SRY-box transcription factor 9 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/sox9
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast