Geeni
OCA2
OCA2 melanosomal transmembrane protein
- HGNC 8101↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000104044↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4948↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 15q12-q13.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 15: 27 754 875–28 099 315 (GRCh38)
- Eksonit
- 24 eksonia 344,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 838 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- BEY, BEY1, BEY2, EYCL, SLC13B1
- Aiemmat symbolit
- D15S12, P, EYCL3, EYCL2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000354638.8NM_000275.3
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/oca2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue OCA2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Okulokutaaninen albinismi
- Autosomaalinen resessiivinen
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
OCA2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,1 kb geenin 344,4 kb:stä; 2 517 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: OCA2
229
OCA2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 344,4 kb geenistä OCA2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 3,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- DCTdopachrome tautomeraseYhteinen sairaus: 1
- LRMDAleucine rich melanocyte differentiation associatedYhteinen sairaus: 1
- SLC24A5solute carrier family 24 member 5Yhteinen sairaus: 1
- SLC45A2solute carrier family 45 member 2Yhteinen sairaus: 1
- TYRtyrosinaseYhteinen sairaus: 1
- TYRP1tyrosinase related protein 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin OCA2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita OCA2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- EEG abnormality
- EEG with abnormally slow frequencies
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased appetite
- Neurodevelopmental delay
- Ventriculomegaly
- Abnormal eating behavior
Näytä 40 piirrettä lisää
- Abnormal speech pattern
- Abnormal temper tantrums
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Binge and purge
- Delayed myelination
- Difficulty sleeping
- Happy demeanor
- Inappropriate laughter
- Intellectual disability, borderline
- Intellectual disability, mild
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Occipital cortical atrophy
- Overactive lower leg reflex
- Parietal cortical atrophy
- Perisylvian polymicrogyria
- Psychosis
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Skin-picking
- Specific learning disability
- Speech articulation difficulties
- Tongue thrusting
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of balance
- Abnormality of movement
- Absent speech development
- Ataxia
- Impaired temperature sensation
- Jerking
- Obstructive sleep apnea
- Poor speech
- Recurrent hand flapping
- Shortened sleep phase
- Tremor
- Wide based walk
Abnormality of the integument
- Freckling
- Loss of hair color
- Patchy lightened skin
- White hair
- Absent skin pigmentation
- Basal cell carcinoma
- Cutaneous melanoma
- Squamous cell carcinoma of the skin
Näytä 4 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). OCA2-geeni: OCA2 melanosomal transmembrane protein. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/oca2
Dante Labs. OCA2-geeni: OCA2 melanosomal transmembrane protein [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/oca2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa