Geen
PSAP
prosaposin
- HGNC 9498↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000197746↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5660↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 10q22.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 10: 71 816 298–71 851 251 (GRCh38)
- Eksonid
- 14 eksonit, ulatus 35 kb
- Valk
- 524 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Varasemad tähised
- SAP1, GLBA, SAP2
- MANE Select transkript
- ENST00000394936.8NM_002778.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PSAP ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Metakromatna leukodüstroofia
- Metakromatna leukodüstroofia (ARSA ja saposiin B puudulikkus)Autosoomne retsessiivne
Arüülsulfataas A aktiivsuse või selle aktivaatori saposiin B aktiivsuse kadu põhjustab liikumis- ja kognitiivsete oskuste progresseeruvat kadu; haigus avaldub hilis-lapseeas, noorukieas ja täiskasvanueas.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geeniteraapia (atidarsagene autotemcel) või tüvirakkude siirdamine võivad aidata, kui neid rakendatakse enne haiguse kulgu või haiguse varases staadiumis, seega on haiguse varajane diagnoosimine oluline.
Laiemad rühmad
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Lüsosomaalne ladustamishaigus
- Lüsosomaalne ladustamishaigus (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 59 sellega seotud geenist
Hõlmab lüsosomaalseid ladustamishaigusi, millel ei ole eraldi raportit, näiteks Farberi tõbe ja muid ASAH1-ga seotud häireid, prosaposiini (PSAP) puudulikkusi, multipelset sulfataasi puudulikkust, mukopolüsahharidoosi tüüpe IX ja X ning Dorfman-Chanarini tõbe; pärilikkuse muster sõltub alatüübist, kõige sagedamini autosomaal-retsessiivne.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PSAP on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,7 kb kogupikkusega 35 kb; neist 1575 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PSAP
79
kohad geenis PSAP, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PSAP 35 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,7 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ARSAarylsulfatase AJagab 3 haigust
- CYP27A1cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1Jagab 2 haigust
- GALCgalactosylceramidaseJagab 2 haigust
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseJagab 1 haigust
- ACER3alkaline ceramidase 3Jagab 1 haigust
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 1 haigust
- AGAaspartylglucosaminidaseJagab 1 haigust
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Jagab 1 haigust
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Jagab 1 haigust
Geeniga PSAP seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PSAP võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abducens palsy
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Cerebral dysmyelination
- Clonic seizure
- Decreased nerve conduction velocity
- Decreased reflex response
- Generalized brain degeneration
- Global developmental delay
Näita veel 71 tunnust
- Hyperactive movements
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Intention tremor
- Jerking
- Loss of ability to walk
- Loss of developmental milestones
- Parkinsonism with favorable response to dopaminergic medication
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral demyelination
- Peripheral nerve disease
- Peripheral neuropathy
- Progressive degeneration of movement
- Repeated seizures without recovery between them
- Tonic seizure
- Vegetative state
- Ventriculomegaly
- Worsening neurological symptoms
- Dystonia
- Grand mal seizures
- Inappropriate crying
- Irritability
- Mental deterioration
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Abnormal gait
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal social behavior
- Can't control feelings
- Clumsiness
- Delayed brainstem auditory evoked response conduction time
- Delusions
- Dementia
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Elevated brain choline level by MRS
- Epilepsy
- Hallucinations
- Inability to coordinate movements when walking
- Leukodystrophy
- Memory impairment
- Progressive gait ataxia
- Progressive peripheral neuropathy
- Psychomotor deterioration
- Punctate periventricular T2 hyperintense foci
- Reduced brain glutamate level by MRS
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Resting tremor
- Short attention span
- Toe walking
- Ataxia
- Babinski sign
- Bulbar signs
- Chorea
- Diffuse cerebral atrophy
- EEG abnormality
- Encephalopathy
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperesthesia
- Hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Loss of speech
- Progressive psychomotor deterioration
- Rise in pressure inside skull
- Schizophrenia
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
- CNS demyelination
- Generalized clonic seizure
- Increased cerebral lipofuscin
- Loss of brain cells
- Muscle twitch
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bone pain
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Spasticity and rigidity of muscles
- Functional motor deficit
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- EMG: chronic denervation signs
- Frequent falls
Näita veel 16 tunnust
Abnormality of the digestive system
- Enlarged liver
- Feeding difficulties
- Abdominal bloating
- Acid reflux
- Feeding difficulties in infancy
- Gallbladder inflammation
- Loss of bowel control
- Nasogastric tube feeding in infancy
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PSAP geen: prosaposin. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/psap
Dante Labs. PSAP geen: prosaposin [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/psap
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast