Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

CHST3

carbohydrate sulfotransferase 3

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
10q22.1
Koordinaadid
Kromosoom 10: 71 964 395–72 013 558 (GRCh38)
Eksonid
3 eksonit, ulatus 49,2 kb
Valk
479 aminohapet
Tuntud ka kui
C6ST, C6ST1
MANE Select transkript
ENST00000373115.5NM_004273.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CHST3 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CHST3 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 10, millel on sulg kohal, kus asub CHST3. CHST3 ja sellele lähedal asuvad 10 geeni kromosoomil 10, vahemikus 71 488 977 kuni 72 488 976.Kromosoom 1010q22.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.371,6 Mb71,8 Mb72 Mb72,2 Mb72,4 MbCDH23: 71 396 884–71 815 947, otsene ahelCDH23C10orf105: 71 711 701–71 737 838, pöördne ahelC10orf105VSIR: 71 747 556–71 773 608, pöördne ahelVSIRPSAP: 71 816 026–71 851 388, pöördne ahelPSAPCHST3: 71 964 395–72 013 558, otsene ahelCHST3SPOCK2: 72 059 016–72 089 032, pöördne ahelSPOCK2ASCC1: 72 092 153–72 217 653, pöördne ahelASCC1ANAPC16: 72 215 651–72 235 860, otsene ahelANAPC16DDIT4: 72 273 919–72 276 039, otsene ahelDDIT4DNAJB12: 72 332 830–72 355 167, pöördne ahelDNAJB12MICU1: 72 355 297–72 626 134, pöördne ahelMICU1CHST3 skeem: 3 eksonit kromosoomi 10 otsene ahelalEkson 2: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 41 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 1: 71 964 395–71 964 694, 300 alustEkson 2: 72 005 736–72 005 982, 247 alustEkson 3: 72 007 172–72 013 558, 6387 alust1235′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 6,9 kb kogupikkusega 49,2 kb; neist 1440 alust kodeerivad valku.

CHST3 sekventeerimine

3Madal

Kui raske on CHST3 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused2,6%
  • GC-sisaldus23%
  • Viitekatvus0%

44

positsioonid geenis CHST3, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.

Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu CHST3 49,2 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 6,9 kb eksoneid.

Geeniga CHST3 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CHST3 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Abnormality of the musculoskeletal system

Näita veel 31 tunnust

Abnormality of limbs

Näita veel 29 tunnust

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CHST3 geen: carbohydrate sulfotransferase 3. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/chst3

Vancouver

Dante Labs. CHST3 geen: carbohydrate sulfotransferase 3 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/chst3

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test