Gen
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000152457↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 64421↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 10p13
- Souřadnice
- Chromozom 10: 14 904 613–14 954 096 (GRCh38)
- Exony
- 14 exonů na 49,5 kb
- Protein
- 692 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Předchozí symboly
- SCIDA
- Transkript MANE Select
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si DCLRE1C i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
DNA Repair Disease
- Autozomálně recesivní
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Severe Combined Immunodeficiency
- Autozomálně recesivní
Severe combined immunodeficiency (SCID) comprises a group of rare monogenic primary immunodeficiency disorders characterized by a lack of functional peripheral T lymphocytes resulting in early-onset severe respiratory infections and failure to thrive. They are classified according to immunological phenotype into SCID with absence of T cells but presence of B cells (T-B+ SCID) or SCID with absence of both (T-B- SCID). Both of these groups include several forms, with or without natural killer (NK) cells.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je DCLRE1C uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6 kb z 49,5 kb genu; 2 079 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte DCLRE1C
149
pozic v genu DCLRE1C, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 58 (39 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (7 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 49,5 kb genu DCLRE1C, včetně intronů, nikoli jen 6 kb exonů.
Varianty se stránkou (22)
Varianty genu DCLRE1C se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Exon 1 | 14 953 929 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.109+1G>T | Intron 1 | 14 953 901 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.161+2T>G | Intron 2 | 14 949 034 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| C116R | c.346T>C | Exon 5 | 14 936 554 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| D136N | c.406G>A | Exon 6 | 14 935 521 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| G118X | c.352G>T | Exon 5 | 14 936 548 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| G135E | c.404G>A | Exon 6 | 14 935 523 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| H35D | c.103C>G | Exon 1 | 14 953 908 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| I16T | c.47T>C | Exon 1 | 14 953 964 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| L47X | c.140T>A | Exon 2 | 14 949 057 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADAadenosine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- AK2adenylate kinase 2Sdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Sdílí 2 onemocnění
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Sdílí 2 onemocnění
- CD247CD247 moleculeSdílí 2 onemocnění
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexSdílí 2 onemocnění
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexSdílí 2 onemocnění
- CD70CD70 moleculeSdílí 2 onemocnění
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorSdílí 2 onemocnění
- CORO1Acoronin 1ASdílí 2 onemocnění
- FOXN1forkhead box N1Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s DCLRE1C
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit DCLRE1C. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Zobrazit ještě 16 rysů
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Zobrazit ještě 13 rysů
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Zobrazit ještě 6 rysů
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen DCLRE1C: DNA cross-link repair 1C. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/dclre1c
Dante Labs. Gen DCLRE1C: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/dclre1c
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů