Gen
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000152457↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 64421↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 10p13
- Koordinater
- Kromosom 10: 14 904 613–14 954 096 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner på 49,5 kb
- Protein
- 692 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Tidigare symboler
- SCIDA
- MANE Select-transkript
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs DCLRE1C, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
DNA-reparationssjukdom
- Autosomalt recessiv
En sjukdom som bygger på en störning i DNA-reparationen.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Svår kombinerad immunbrist
- Autosomalt recessiv
Svår kombinerad immunbrist (SCID) omfattar en grupp sällsynta, monogena primära immunbristsjukdomar som kännetecknas av brist på fungerande perifera T-lymfocyter. Det leder till allvarliga luftvägsinfektioner med tidig debut och tillväxtsvikt. Sjukdomarna klassificeras efter immunologisk fenotyp i SCID med avsaknad av T-celler men närvaro av B-celler (T-B+ SCID) eller SCID med avsaknad av båda (T-B- SCID). Båda grupperna omfattar flera former, med eller utan naturliga dödarceller (NK-celler).
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är DCLRE1C uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6 kb av genens 49,5 kb, och 2 079 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest DCLRE1C
149
positioner i DCLRE1C där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
58 av dem (39 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (7 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 ställen)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalys täcker alla 49,5 kb av DCLRE1C, med introner inräknade, inte bara de 6 kb exoner.
Varianter med egen sida (22)
De DCLRE1C-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Exon 1 | 14 953 929 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.109+1G>T | Intron 1 | 14 953 901 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.161+2T>G | Intron 2 | 14 949 034 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| C116R | c.346T>C | Exon 5 | 14 936 554 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| D136N | c.406G>A | Exon 6 | 14 935 521 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| G118X | c.352G>T | Exon 5 | 14 936 548 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| G135E | c.404G>A | Exon 6 | 14 935 523 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| H35D | c.103C>G | Exon 1 | 14 953 908 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| I16T | c.47T>C | Exon 1 | 14 953 964 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| L47X | c.140T>A | Exon 2 | 14 949 057 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 2 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 2 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 2 tillstånd
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Delar 2 tillstånd
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Delar 2 tillstånd
- CD247CD247 moleculeDelar 2 tillstånd
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDelar 2 tillstånd
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDelar 2 tillstånd
- CD70CD70 moleculeDelar 2 tillstånd
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDelar 2 tillstånd
- CORO1Acoronin 1ADelar 2 tillstånd
- FOXN1forkhead box N1Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till DCLRE1C
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som DCLRE1C kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Visa ytterligare 16 egenskaper
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Visa ytterligare 13 egenskaper
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Visa ytterligare 6 egenskaper
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). DCLRE1C-genen: DNA cross-link repair 1C. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/dclre1c
Dante Labs. DCLRE1C-genen: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/dclre1c
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor