Gén
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000152457↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 64421↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 10p13
- Koordináták
- 10. kromoszóma: 14 904 613–14 954 096 (GRCh38)
- Exonok
- 14 exon, összesen 49,5 kb
- Fehérje
- 692 aminosav
- Más néven ismert
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Korábbi jelölések
- SCIDA
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dclre1c.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a DCLRE1C-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
DNA Repair Disease
- Autoszomális recesszív
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Severe Combined Immunodeficiency
- Autoszomális recesszív
Severe combined immunodeficiency (SCID) comprises a group of rare monogenic primary immunodeficiency disorders characterized by a lack of functional peripheral T lymphocytes resulting in early-onset severe respiratory infections and failure to thrive. They are classified according to immunological phenotype into SCID with absence of T cells but presence of B cells (T-B+ SCID) or SCID with absence of both (T-B- SCID). Both of these groups include several forms, with or without natural killer (NK) cells.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
A 170 hozzá kapcsolódó gén egyike
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
A DCLRE1C felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 49,5 kb-jából 6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2079 bázis kódolja a fehérjét.
DCLRE1C szekvenálása
149
DCLRE1C-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 58 (39%) olyan régiókba esnek, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
- Low mappability (7 pozíció)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 pozíció)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genomszekvenálás a DCLRE1C gén mind a 49,5 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 6 kb-át.
Oldallal rendelkező variánsok (22)
Az itt található, oldallal rendelkező DCLRE1C variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | 1. exon | 14 953 929 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| c.109+1G>T | 1. intron | 14 953 901 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.161+2T>G | 2. intron | 14 949 034 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| C116R | c.346T>C | 5. exon | 14 936 554 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| D136N | c.406G>A | 6. exon | 14 935 521 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G118X | c.352G>T | 5. exon | 14 936 548 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G135E | c.404G>A | 6. exon | 14 935 523 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| H35D | c.103C>G | 1. exon | 14 953 908 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| I16T | c.47T>C | 1. exon | 14 953 964 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| L47X | c.140T>A | 2. exon | 14 949 057 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ADAadenosine deaminase2 betegséget oszt meg
- AK2adenylate kinase 22 betegséget oszt meg
- BCL11BBCL11 transcription factor B2 betegséget oszt meg
- CARD11caspase recruitment domain family member 112 betegséget oszt meg
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 22 betegséget oszt meg
- CD247CD247 molecule2 betegséget oszt meg
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complex2 betegséget oszt meg
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complex2 betegséget oszt meg
- CD70CD70 molecule2 betegséget oszt meg
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivator2 betegséget oszt meg
- CORO1Acoronin 1A2 betegséget oszt meg
- FOXN1forkhead box N12 betegséget oszt meg
A(z) DCLRE1C génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) DCLRE1C gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Még 16 tulajdonság megjelenítése
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Még 13 tulajdonság megjelenítése
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Még 6 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). DCLRE1C gén: DNA cross-link repair 1C. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/dclre1c
Dante Labs. DCLRE1C gén: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/dclre1c
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt