Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

FAM171A1

family with sequence similarity 171 member A1

Shrnutí

Cytogenetická poloha
10p13
Souřadnice
Chromozom 10: 15 211 643–15 371 289 (GRCh38)
Exony
8 exonů na 159,6 kb
Protein
890 aminokyselin, 97,9 kDa
Další názvy
FLJ12884, APCN
Předchozí symboly
C10orf38
Transkript MANE Select
ENST00000378116.9NM_001010924.2
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen FAM171A1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je FAM171A1 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 10, se závorkou u FAM171A1. FAM171A1 a 12 genů poblíž na chromozomu 10, od 14 791 466 do 15 791 465.Chromozom 1010p13p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.314,8 Mb15 Mb15,2 Mb15,4 Mb15,6 MbCDNF: 14 817 775–14 838 575, řetězec zpětnémCDNFHSPA14: 14 838 164–14 871 852, řetězec dopřednémHSPA14MSANTD7: 14 838 164–14 846 999, řetězec dopřednémMSANTD7SUV39H2: 14 878 323–14 906 331, řetězec dopřednémSUV39H2DCLRE1C: 14 897 359–14 954 432, řetězec zpětnémDCLRE1CMEIG1: 14 954 190–14 988 050, řetězec dopřednémMEIG1OLAH: 15 032 227–15 073 853, řetězec dopřednémOLAHACBD7: 15 073 038–15 088 802, řetězec zpětnémACBD7RPP38: 15 097 073–15 139 818, řetězec dopřednémRPP38NMT2: 15 102 584–15 168 724, řetězec zpětnémNMT2FAM171A1: 15 211 643–15 371 289, řetězec zpětnémFAM171A1ITGA8: 15 513 954–15 720 359, řetězec zpětnémITGA8MINDY3: 15 776 915–15 860 553, řetězec zpětnémMINDY3Schéma FAM171A1: 8 exonů na zpětném řetězci chromozomu 10Exon 8: 15 211 643–15 214 601, 2 959 bázíExon 7: 15 215 996–15 216 110, 115 bázíExon 6: 15 220 944–15 221 060, 117 bázíExon 5: 15 248 639–15 248 815, 177 bázíExon 4: 15 254 721–15 254 879, 159 bázíExon 3: 15 275 855–15 275 947, 93 bázíExon 2: 15 283 878–15 284 105, 228 bázíExon 1: 15 370 956–15 371 289, 334 bází876543215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 4,2 kb z 159,6 kb genu; 2 673 těchto bází kódují protein.

Sekvenování FAM171A1

3Snadné

Jak obtížně se FAM171A1 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu FAM171A1 leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu FAM171A1 v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice4,4 %
  • Obsah GC8 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen FAM171A1: family with sequence similarity 171 member A1. Staženo 21. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/fam171a1

Vancouver

Dante Labs. Gen FAM171A1: family with sequence similarity 171 member A1 [Internet]. [citováno 21. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/fam171a1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test