Gene
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000152457↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 64421↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 10p13
- Coordinate
- Cromosoma 10: 14.904.613–14.954.096 (GRCh38)
- Esoni
- 14 esoni su 49,5 kb
- Proteina
- 692 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Simboli precedenti
- SCIDA
- Trascritto MANE Select
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Malattia della riparazione del DNA
- Autosomica recessiva
Una patologia che ha origine dall'alterazione dei meccanismi di riparazione del DNA.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Immunodeficienza combinata grave
- Autosomica recessiva
L'immunodeficienza combinata grave (SCID) comprende un gruppo di rare immunodeficienze primarie di origine monogenica, caratterizzate dalla mancanza di linfociti T periferici funzionali, che porta a infezioni respiratorie gravi a esordio precoce e a un ritardo nella crescita. Tali condizioni vengono classificate in base al fenotipo immunologico in SCID con assenza di cellule T ma presenza di cellule B (SCID T-B+) o SCID con assenza di entrambe (SCID T-B-). Entrambi i gruppi includono diverse forme, con o senza cellule natural killer (NK).
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di DCLRE1C
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 6 kb dei 49,5 kb del gene; 2079 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge DCLRE1C
149
posizioni in DCLRE1C in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
58 di esse (39%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Low mappability (7 siti)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma intero copre tutti i 49,5 kb di DCLRE1C, introni inclusi, non solo i 6 kb di esoni.
Varianti con una pagina (22)
Le varianti DCLRE1C con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Esone 1 | 14.953.929 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| c.109+1G>T | Introne 1 | 14.953.901 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.161+2T>G | Introne 2 | 14.949.034 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| C116R | c.346T>C | Esone 5 | 14.936.554 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| D136N | c.406G>A | Esone 6 | 14.935.521 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| G118X | c.352G>T | Esone 5 | 14.936.548 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| G135E | c.404G>A | Esone 6 | 14.935.523 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| H35D | c.103C>G | Esone 1 | 14.953.908 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| I16T | c.47T>C | Esone 1 | 14.953.964 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| L47X | c.140T>A | Esone 2 | 14.949.057 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAadenosine deaminaseCondivide 2 condizioni
- AK2adenylate kinase 2Condivide 2 condizioni
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 2 condizioni
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Condivide 2 condizioni
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Condivide 2 condizioni
- CD247CD247 moleculeCondivide 2 condizioni
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexCondivide 2 condizioni
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexCondivide 2 condizioni
- CD70CD70 moleculeCondivide 2 condizioni
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorCondivide 2 condizioni
- CORO1Acoronin 1ACondivide 2 condizioni
- FOXN1forkhead box N1Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a DCLRE1C
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che DCLRE1C può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Mostra altri 16 tratti
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Mostra altri 13 tratti
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Mostra altri 6 tratti
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Mostra altri 4 tratti
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene DCLRE1C: DNA cross-link repair 1C. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/dclre1c
Dante Labs. Gene DCLRE1C: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/dclre1c
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