Gen
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000152457↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 64421↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 10p13
- Koordinater
- Kromosom 10: 14.904.613–14.954.096 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner fordelt over 49,5 kb
- Protein
- 692 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal recessiv
- Også kendt som
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Tidligere symboler
- SCIDA
- MANE Select-transkript
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Læs DCLRE1C og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
DNA-reparationssygdom
- Autosomal recessiv
En sygdom, der har sin baggrund i forstyrrelse af DNA-reparation.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Svær kombineret immundefekt
- Autosomal recessiv
Svær kombineret immundefekt (SCID) omfatter en gruppe sjældne monogene primære immundefekt-lidelser, karakteriseret ved mangel på funktionelle perifere T-lymfocytter, hvilket resulterer i tidligt opståede, svære luftvejsinfektioner og manglende vækst. De klassificeres efter immunologisk fænotype i SCID med fravær af T-celler, men tilstedeværelse af B-celler (T-B+ SCID), eller SCID med fravær af både T- og B-celler (T-B- SCID). Begge grupper omfatter flere former, med eller uden naturlige killerceller (NK-celler).
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Immunsvigtsygdom
Et af 170 gener, der er knyttet til det
Sygdom, hvor der er mangel på eller defekt i immunforsvarets mekanismer, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
HSCT ved SCID og alvorlige PID'er; immunglobulinbehandling (IVIG/SCIG) ved antistofmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4-/LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Arvegang
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er DCLRE1C opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 6 kb af genets 49,5 kb; 2.079 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest DCLRE1C
149
positioner i DCLRE1C, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
58 af dem (39 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (7 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 steder)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalyse dækker alle 49,5 kb af DCLRE1C, inklusive introner, og ikke kun de 6 kb eksoner.
Varianter med en side (22)
Her vises de DCLRE1C-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Exon 1 | 14.953.929 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| c.109+1G>T | Intron 1 | 14.953.901 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.161+2T>G | Intron 2 | 14.949.034 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| C116R | c.346T>C | Exon 5 | 14.936.554 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| D136N | c.406G>A | Exon 6 | 14.935.521 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| G118X | c.352G>T | Exon 5 | 14.936.548 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| G135E | c.404G>A | Exon 6 | 14.935.523 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| H35D | c.103C>G | Exon 1 | 14.953.908 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| I16T | c.47T>C | Exon 1 | 14.953.964 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| L47X | c.140T>A | Exon 2 | 14.949.057 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ADAadenosine deaminaseDeler 2 sygdomme
- AK2adenylate kinase 2Deler 2 sygdomme
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 2 sygdomme
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Deler 2 sygdomme
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Deler 2 sygdomme
- CD247CD247 moleculeDeler 2 sygdomme
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDeler 2 sygdomme
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDeler 2 sygdomme
- CD70CD70 moleculeDeler 2 sygdomme
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDeler 2 sygdomme
- CORO1Acoronin 1ADeler 2 sygdomme
- FOXN1forkhead box N1Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til DCLRE1C
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, DCLRE1C kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Vis 16 træk mere
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Vis 13 træk mere
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). DCLRE1C-genet: DNA cross-link repair 1C. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/dclre1c
Dante Labs. DCLRE1C-genet: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/dclre1c
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger