Gen
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000152457↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 64421↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 10p13
- Coördinaten
- Chromosoom 10: 14.904.613–14.954.096 (GRCh38)
- Exons
- 14 exons over 49,5 kb
- Eiwit
- 692 aminozuren
- Ook bekend als
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Eerdere symbolen
- SCIDA
- MANE Select-transcript
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dclre1c.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees DCLRE1C en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
DNA-herstelziekte
- Autosomaal recessief
Een ziekte die zijn oorsprong heeft in een verstoring van het herstel van DNA.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Ernstige gecombineerde immuundeficiëntie
- Autosomaal recessief
Ernstige gecombineerde immuundeficiëntie (SCID) omvat een groep zeldzame monogene primaire immuundeficiëntieziekten die worden gekenmerkt door een gebrek aan functionele perifere T-lymfocyten, wat leidt tot ernstige luchtweginfecties die al vroeg in het leven optreden en tot een achterblijvende groei. Ze worden naar immunologisch fenotype ingedeeld in SCID met afwezigheid van T-cellen maar aanwezigheid van B-cellen (T-B+ SCID) of SCID met afwezigheid van beide (T-B- SCID). Beide groepen omvatten verschillende vormen, met of zonder natural killer (NK)-cellen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Immuundeficiëntieziekte
Een van 170 genen die hiermee verband houden
Ziekte waarbij er een tekort of defect is in de mechanismen van de immuniteit, zowel cellulair als humoraal.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
HSCT bij SCID en ernstige PID's; immunoglobulinevervangende therapie (IVIG/SCIG) bij antilichaamdeficiënties; leniolisib (Joenja, FDA 2023) bij APDS; genetherapie bij ADA-SCID; abatacept bij CTLA4- of LRBA-deficiëntie; profylactische antibiotica; G-CSF bij CGD
Opbouw van DCLRE1C
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 6 kb van de 49,5 kb van het gen; 2.079 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van DCLRE1C
149
posities in DCLRE1C waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
58 daarvan (39%) vallen in gebieden waar korte reads moeilijk zijn.
- Low mappability (7 locaties)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 locaties)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een whole genome dekt alle 49,5 kb van DCLRE1C, inclusief intronen, en niet alleen de 6 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (22)
De DCLRE1C-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Exon 1 | 14.953.929 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.109+1G>T | Intron 1 | 14.953.901 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.161+2T>G | Intron 2 | 14.949.034 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| C116R | c.346T>C | Exon 5 | 14.936.554 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| D136N | c.406G>A | Exon 6 | 14.935.521 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G118X | c.352G>T | Exon 5 | 14.936.548 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G135E | c.404G>A | Exon 6 | 14.935.523 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| H35D | c.103C>G | Exon 1 | 14.953.908 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| I16T | c.47T>C | Exon 1 | 14.953.964 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| L47X | c.140T>A | Exon 2 | 14.949.057 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ADAadenosine deaminaseDeelt 2 aandoeningen
- AK2adenylate kinase 2Deelt 2 aandoeningen
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeelt 2 aandoeningen
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Deelt 2 aandoeningen
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Deelt 2 aandoeningen
- CD247CD247 moleculeDeelt 2 aandoeningen
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDeelt 2 aandoeningen
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexDeelt 2 aandoeningen
- CD70CD70 moleculeDeelt 2 aandoeningen
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDeelt 2 aandoeningen
- CORO1Acoronin 1ADeelt 2 aandoeningen
- FOXN1forkhead box N1Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan DCLRE1C
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die DCLRE1C kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Toon 16 kenmerken meer
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Toon 13 kenmerken meer
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Toon 6 kenmerken meer
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). DCLRE1C-gen: DNA cross-link repair 1C. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/dclre1c
Dante Labs. DCLRE1C-gen: DNA cross-link repair 1C [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/dclre1c
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken