Genas
DCLRE1C
DNA cross-link repair 1C
- HGNC 17642↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000152457↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 64421↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 10p13
- Koordinatės
- Chromosoma 10: 14 904 613–14 954 096 (GRCh38)
- Eksonai
- 14 eksonų per 49,5 kb
- Baltymas
- 692 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- ARTEMIS, FLJ11360, SNM1C, A-SCID
- Ankstesni simboliai
- SCIDA
- MANE Select transkriptas
- ENST00000378278.7NM_001033855.3
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dclre1c.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite DCLRE1C ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
DNA taisymo sutrikimo liga
- Autosominis recesyvinis
Liga, kurios pagrindas – DNR taisymo mechanizmo sutrikimas.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Teži kombinuotas imunodeficitas
- Autosominis recesyvinis
Teži kombinuotas imunodeficitas (SCID) – tai retų monogeninių pirminių imunodeficitų grupė, kuriai būdingas funkcinių periferinių T limfocitų trūkumas, sukeliantis ankstyvas sunkias kvėpavimo takų infekcijas ir nepakankamą vaikų augimą bei vystymąsi. Pagal imunologinį fenotipą jie skirstomi į SCID, kai nėra T ląstelių, bet yra B ląstelių (T-B+ SCID), ir SCID, kai nėra abiejų (T-B- SCID). Abi šios grupės apima kelias formas, su natūraliųjų žudikų (NK) ląstelėmis arba be jų.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Platesnės grupės
Kiti įgimti imunodeficitai
- Imunodeficito liga
Vienas iš 170 su juo susijusių genų
Liga, kai sutrikusi arba nepakankamai išsivysčiusi imuninė apsauga – tiek ląstelinė, tiek humoralinė.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
HSCT (hematopoetinių kamieninių ląstelių transplantacija) taikoma SCID ir sunkioms pirminėms imunodeficito ligoms gydyti; imunoglobulinų papildymas (IVIG/SCIG) – antikūnų nepakankamumui; leniolisibas (Joenja, FDA 2023) – APDS; genų terapija – ADA-SCID; abatacepto – CTLA4 ir LRBA nepakankamumui; profilaktiniai antibiotikai; G-CSF – CGD
Kaip išdėstytas DCLRE1C
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 6 kb iš 49,5 kb geno; 2 079 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: DCLRE1C
149
vietos geno DCLRE1C sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Iš jų 58 (39 %) patenka į sritis, kuriose trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
- Low mappability (7 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (58 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 49,5 kb geno DCLRE1C, įskaitant intronus, o ne tik 6 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (22)
Čia pateikiami DCLRE1C variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A28P | c.82G>C | Eksonas 1 | 14 953 929 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.109+1G>T | Intronas 1 | 14 953 901 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.161+2T>G | Intronas 2 | 14 949 034 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| C116R | c.346T>C | Eksonas 5 | 14 936 554 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| D136N | c.406G>A | Eksonas 6 | 14 935 521 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G118X | c.352G>T | Eksonas 5 | 14 936 548 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G135E | c.404G>A | Eksonas 6 | 14 935 523 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| H35D | c.103C>G | Eksonas 1 | 14 953 908 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| I16T | c.47T>C | Eksonas 1 | 14 953 964 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L47X | c.140T>A | Eksonas 2 | 14 949 057 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ADAadenosine deaminaseTuri 2 bendrų būklių
- AK2adenylate kinase 2Turi 2 bendrų būklių
- BCL11BBCL11 transcription factor BTuri 2 bendrų būklių
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Turi 2 bendrų būklių
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Turi 2 bendrų būklių
- CD247CD247 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD3ECD3 epsilon subunit of T-cell receptor complexTuri 2 bendrų būklių
- CD70CD70 moleculeTuri 2 bendrų būklių
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorTuri 2 bendrų būklių
- CORO1Acoronin 1ATuri 2 bendrų būklių
- FOXN1forkhead box N1Turi 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su DCLRE1C
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti DCLRE1C, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the immune system
- BCGitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Congenital exfoliative erythroderma
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased immune function
- Eczema
- Eosinophilic dermal infiltration
- Infection in blood stream
Rodyti dar 16 savybių
- Meningitis
- Pimple
- Pneumonia
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent skin infections
- Recurrent viral infections
- Skin rash
- Subcutaneous abscess
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Severe combined immunodeficiency
- Cutaneous granuloma
- Recurrent opportunistic infections
- Skin abscess
- Autoimmunity
- Recurrent mycobacterial infections
- Recurrent fungal infections
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormally low T cell receptor excision circle level
- Absent circulating B cells
- Absent circulating T cells
- Absent natural killer cells
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased naive CD4+ T cell proportion
- Decreased total CD8+ T cell proportion
- Elevated white blood count
Rodyti dar 13 savybių
- High blood eosinophil count
- Increased CD4:CD8 ratio
- Low B cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Oligoclonal T cell expansion
- Abnormal lymphocyte morphology
- Autoimmune hemolytic anemia
- High lymphocyte count
- Autoimmune thrombocytopenia
- Cancer of lymphatic system
- Low T cell count
- Low platelet count
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Erythematous papule
- Hair loss
- Hyperkeratosis
- Parakeratosis
- Psoriasiform acanthosis
- Scaling skin
- Sparse hair
Rodyti dar 6 savybių
Abnormality of the cardiovascular system
- Absent thymus
- Axillary lymphadenopathy
- Generalized swelling of lymph nodes
- Increased spleen size
- Inguinal lymphadenopathy
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes in the neck
- Swollen lymph nodes
Rodyti dar 4 savybių
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chronic oral thrush
- Recurrent upper and lower respiratory tract infections
- Sparse or absent eyebrows
- Recurrent canker sores
- Mouth sore
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). DCLRE1C genas: DNA cross-link repair 1C. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/dclre1c
Dante Labs. DCLRE1C genas: DNA cross-link repair 1C [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/dclre1c
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites