Gén
SCN9A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 9
- HGNC 10597↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000169432↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 6335↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 2q24.3
- Koordináták
- 2. kromoszóma: 166 195 185–166 375 944 (GRCh38)
- Exonok
- 27 exon, összesen 180,8 kb
- Fehérje
- 1988 aminosav
- Más néven ismert
- Nav1.7, PN1, NE-NA, NENA, ETHA
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000642356.2NM_001365536.1
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scn9a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SCN9A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathies (incl. Familial Dysautonomia)
- Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathy
A group of neuropathies, including familial dysautonomia (ELP1), HSAN1 (SPTLC1/SPTLC2), HSAN2 (WNK1, RETREG1) and congenital insensitivity to pain (NTRK1, SCN9A, PRDM12), most of which are recessive while HSAN1 is dominant.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Protection against unnoticed injuries, burns and infections, management of autonomic symptoms, and carrier testing for relatives (familial dysautonomia is included in Ashkenazi Jewish carrier screening).
Átfogóbb csoportosítások
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A SCN9A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 180,8 kb-jából 9,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5967 bázis kódolja a fehérjét.
SCN9A szekvenálása
155
SCN9A-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 6 (3,9%) olyan régiókba esnek, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
- Low mappability (6 pozíció)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
A teljes genomszekvenálás a SCN9A gén mind a 180,8 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 9,8 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 betegséget oszt meg
- ACTL6Bactin like 6B1 betegséget oszt meg
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 betegséget oszt meg
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 11 betegséget oszt meg
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 betegséget oszt meg
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 betegséget oszt meg
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 betegséget oszt meg
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 betegséget oszt meg
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulator1 betegséget oszt meg
- ARXaristaless related homeobox1 betegséget oszt meg
- ATL1atlastin GTPase 11 betegséget oszt meg
A(z) SCN9A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SCN9A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Pain insensitivity
- Epilepsy
- Generalized-onset seizure
- Loss of developmental milestones
- Peripheral neuropathy
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Anxiety
Még 49 tulajdonság megjelenítése
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cognitive impairment
- Complex febrile seizure
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Interictal epileptiform activity
- Jerking
- Multifocal epileptiform discharges
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Action tremor
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
- Cortical dysplasia
- Decreased sensation in extremities
- Dysesthesia
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Grand mal seizures
- Impulsivity
- Incoordination
- Poor fine motor coordination
- Short attention span
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Generalized tonic seizure
- Repeated seizures without recovery between them
- Tremor
- Absent reflexes
- Decreased nerve conduction velocity
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased reflex response
- Decreased sensory nerve conduction velocity
- Impaired pain sensation
Abnormality of limbs
- Abnormality of the ankle
- Abnormality of the knee
- Foot acroosteolysis
- Tapered finger
- Decreased/absent ankle reflexes
- Dropped arches
- Fluid accumulation in lower limbs
- Limited knee straightening
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal cortical bone morphology
- Abnormal shape of end part of bone
- Abnormality of the hip bone
- Breakdown of bone
- Low solidness and mass of the bones
- Muscle degeneration
- Prominent swayback
- Cogwheel rigidity
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the integument
- Excessive sweating
- Poor fingernail formation
- Poor toenail formation
- Itching
- Cyanotic episode
- Paleness
- Acral ulceration
- Decreased ability to sweat
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of head or neck
- Extra bones within cranial sutures
- Facial tics
- Limited neck range of motion
- Drooling
- Decreased salivary flow
- Decreased taste
- Dry eye syndrome
- Hyposmia
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SCN9A gén: sodium voltage-gated channel alpha subunit 9. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/scn9a
Dante Labs. SCN9A gén: sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/scn9a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt