Gène
RNU12
RNA, U12 small nuclear
- HGNC 19380↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000276027↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 267010↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 22q13.2
- Coordonnées
- Chromosome 22 : 42 615 244–42 615 393 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon sur 0,2 kb
- Aussi appelé
- RNU12-1
- Symboles précédents
- RNU12P
- Transcrit MANE Select
- ENST00000362512.1NR_029422.2
- Type de locus
- Petit ARN nucléaire (snARN)
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Craniosténose syndromique
Maladies associant une fermeture précoce des sutures crâniennes à d'autres signes, notamment les syndromes d'Apert, de Crouzon, de Pfeiffer, de Muenke et de Saethre-Chotzen, causées par des gènes tels que FGFR2, FGFR3, FGFR1, TWIST1, TCF12 et ERF.
- 1 évaluateur GenCC le classe comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Un diagnostic précoce permet une chirurgie au bon moment et un suivi de la croissance du crâne, de la vision et de l'audition ; les formes plus légères, comme le syndrome de Muenke, peuvent passer inaperçues chez l'adulte, ce qui est important pour la planification familiale.
Structure de RNU12
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 0,2 kb sur les 0,2 kb du gène.
Séquençage de RNU12
0Faible
Difficulté de séquençage de RNU12 avec des lectures courtes, sur 100Chaque barre représente la part des bases d'exons de RNU12 situées dans ce type de région difficile. Le score les pondère selon le coût de chacune pour un appel en lecture courte : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une telle région, 100 lorsque chaque base se trouve dans toutes.
- CartographiabilitéZones où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel à cet endroit peut être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.0 %
- Teneur en GCFenêtres dont le taux de G et de C est inférieur à 25 % ou supérieur à 65 %, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.0 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
7
positions dans RNU12 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.
Un génome complet couvre les 0,2 kb de RNU12, introns compris, et pas seulement les 0,2 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- CYP26B1cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1Partage 1 affection
- ERFETS2 repressor factorPartage 1 affection
- FGFR1fibroblast growth factor receptor 1Partage 1 affection
- FGFR2fibroblast growth factor receptor 2Partage 1 affection
- FGFR3fibroblast growth factor receptor 3Partage 1 affection
- IFT122intraflagellar transport 122Partage 1 affection
- IFT43intraflagellar transport 43Partage 1 affection
- IFT52intraflagellar transport 52Partage 1 affection
- IL11RAinterleukin 11 receptor subunit alphaPartage 1 affection
- KAT6Alysine acetyltransferase 6APartage 1 affection
- MEGF8multiple EGF like domains 8Partage 1 affection
- MSX2msh homeobox 2Partage 1 affection
Traits associés à RNU12
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que RNU12 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of head or neck
- Coronal craniosynostosis
- Enlarged cisterna magna
- Holes in parietal bones
- Wide fontanelles
- Abnormal tooth enamel
- Abnormality of dental shape
- Abnormality of the palate
- Absent eyebrow
Afficher 19 traits supplémentaires
- Absent eyelashes
- Broad head shape
- Delayed cranial suture closure
- Frontal bossing
- Large posterior fontanelle
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Early closure of midline skull joint
- Full lips
- Lambdoidal craniosynostosis
- Little lower jaw
- Wide mouth
- Zygomatic flattening
- Asymmetry of the posterior head
- Cleft palate
- Everted eyelid
- Midface retrusion
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Sparse scalp hair
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Dilated fourth ventricle
- Head titubation
- Inability to coordinate movements when walking
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Intention tremor
- Small cerebellum
- Wide based walk
Afficher 13 traits supplémentaires
- Difficulty articulating speech
- Abnormal gait
- Cerebellar vermis atrophy
- Degeneration of cerebellum
- Delayed motor skills
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Neurodevelopmental abnormality
- Poor fine motor coordination
- Focal impaired awareness seizure
- Abnormal corpus callosum morphology
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
Abnormality of the musculoskeletal system
- Frequent falls
- Generalized muscle weakness
- Abnormal collarbone
- Absent collarbone
- Delayed bone maturation
- Low muscle tone
- Short collarbone
- Shorter than typical length between neck and abdomen
Afficher 3 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-17 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.18-e609d43e.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène RNU12 : RNA, U12 small nuclear. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rnu12
Dante Labs. Gène RNU12 : RNA, U12 small nuclear [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rnu12
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