Geeni
LARGE1
LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1
- HGNC 6511↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000133424↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 9215↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 22q12.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 22: 33 272 509–33 920 476 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 648 kb:n alueella
- Proteiini
- 756 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA0609
- Aiemmat symbolit
- LARGE
- MANE Select -transkripti
- ENST00000397394.8NM_133642.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue LARGE1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Synnynnäiset lihasdystrofiat
- Synnynnäinen lihasdystrofia
Lihasdystrofioiden ryhmä, jonka oireet alkavat syntymässä tai imeväisiässä. Ryhmään kuuluvat myös dystroglykanopatiat (kuten FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-liitännäiset muodot).
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
LARGE1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 648 kb:stä; 2 271 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä LARGE1
29
LARGE1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 648 kb geenistä LARGE1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Yhteinen sairaus: 1
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Yhteinen sairaus: 1
- CHKBcholine kinase betaYhteinen sairaus: 1
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainYhteinen sairaus: 1
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainYhteinen sairaus: 1
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AYhteinen sairaus: 1
- DAG1dystroglycan 1Yhteinen sairaus: 1
- DOK7docking protein 7Yhteinen sairaus: 1
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryYhteinen sairaus: 1
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryYhteinen sairaus: 1
Geeniin LARGE1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita LARGE1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Absent speech development
- Agyria
- Aplasia of the inferior half of the cerebellar vermis
- Babinski sign
- Delayed ability to sit
Näytä 47 piirrettä lisää
- Delayed ability to walk
- Epilepsy
- Fewer and broader ridges in brain
- Global developmental delay
- Hand mirror movements
- IQ less than 20
- Overactive lower leg reflex
- Small brainstem
- Small cerebellum
- Type II lissencephaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Cognitive impairment
- Decreased reflex response
- EEG abnormality
- Fewer or absent grooves in brain
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Specific learning disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Abnormality of movement
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dilated third ventricle
- Kinked brainstem
- Lateral ventricle dilatation
- Motor delay
- Poor gross motor coordination
- Abnormal pons morphology
- Abnormality of the nervous system
- Absent/small cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Diminished deep tendon reflex
- Holoprosencephaly
- Intellectual disability, severe
- Loss of ability to walk
- Meningocele
- Paralysis or weakness of one side of body
- Poor speech
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Cerebellar dysplasia
- Excessive daytime sleepiness
- Hypoplasia of the pons
Abnormality of the eye
- Abnormally small eyeball
- Corneal opacity
- Decreased light- and dark-adapted electroretinogram amplitude
- Horizontal nystagmus
- Retinal dysplasia
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Chorioretinal dysplasia
- Close sighted
Näytä 21 piirrettä lisää
- Cross-eyed
- Glaucoma
- Optic atrophy
- Optic nerve issue
- Retinal detachment
- Visual impairment
- Absence of eyeballs
- Clouding of the lens of the eye
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Pigmentary retinopathy
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Abnormality of the eye
- Cat eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Blindness
- Enlarged cornea
- Enlarged eyeball
- Notched pupil
- Optic nerve hypoplasia
- Peters anomaly
- Retinal atrophy
Abnormality of the musculoskeletal system
- Generalized decreased muscle tone
- Increased skeletal muscle cells
- Low muscle tone
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Absent/small skeletal muscles
- Decreased muscle tone in infant
- EMG abnormality
Näytä 19 piirrettä lisää
- Hypoglycosylation of alpha-dystroglycan
- Muscle degeneration
- Muscle tissue disease
- Muscle weakness
- Muscular dystrophy
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Fatigable weakness of skeletal muscles
- Increased endomysial connective tissue
- Multiple joint contractures
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormality of connective tissue
- Axial muscle weakness
- Limited neck movement
- Neuropathic spinal arthropathy
- Scoliosis
- Congenital contracture
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Severely decreased muscle tone
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). LARGE1-geeni: LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/large1
Dante Labs. LARGE1-geeni: LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/large1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa