Geeni
COL6A3
collagen type VI alpha 3 chain
- HGNC 2213↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000163359↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 1293↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q37.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 237 324 018–237 414 164 (GRCh38)
- Eksonit
- 44 eksonia 90,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 3 177 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- MANE Select -transkripti
- ENST00000295550.9NM_004369.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue COL6A3 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Synnynnäiset lihasdystrofiat
- Kollageeni VI:een liittyvä myopatia
Lihassairauksien kirjo, jonka aiheuttavat COL6A1-, COL6A2- tai COL6A3-variantit. Oireet vaihtelevat vaikeasta Ullrichin synnynnäisestä lihasdystrofiasta lievempään Bethlemin myopatiaan. Oireina ovat heikkous ja nivelten kontraktuurit.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Synnynnäinen lihasdystrofia
Lihasdystrofioiden ryhmä, jonka oireet alkavat syntymässä tai imeväisiässä. Ryhmään kuuluvat myös dystroglykanopatiat (kuten FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-liitännäiset muodot).
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Dystonia, myotonia, paroksysmaalinen dyskinesia
- Dystonia 27Autosomaalinen resessiivinen
Mikä tahansa dystoninen häiriö, jonka sairauden aiheuttaa COL6A3-geenin mutaatio.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Perinnöllinen dystonia
Yleisnimitys perinnöllisille dystonioille, mukaan lukien DYT-TOR1A-varhaisalkuinen yleistynyt dystonia, DYT-THAP1, myoklonus-dystonia (SGCE) ja KMT2B-liitännäinen dystonia.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Raajalihasdystrofia (Limb-Girdle)
- Raajavyöhykkeen lihasdystrofia
Raajavyöhykkeen lihasdystrofialla tarkoitetaan useita alatyyppejä, joilla on erilaiset periytymismallit (ja myös diagnoosin varmuus vaihtelee). Taudin kanssa yhteydessä olevia variantteja kantavien kannattaa hakeutua lihas- ja luustoerikoislääkärin arvioon varmistavaa diagnoosia varten.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
COL6A3-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 10,5 kb geenin 90,1 kb:stä; 9 534 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä COL6A3
150
COL6A3-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 90,1 kb geenistä COL6A3, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 10,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainYhteisiä sairauksia: 3
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainYhteisiä sairauksia: 3
- DAG1dystroglycan 1Yhteisiä sairauksia: 2
- FKRPfukutin related proteinYhteisiä sairauksia: 2
- FKTNfukutinYhteisiä sairauksia: 2
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BYhteisiä sairauksia: 2
- LAMA2laminin subunit alpha 2Yhteisiä sairauksia: 2
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Yhteisiä sairauksia: 2
- SNUPNsnurportin 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ACTBactin betaYhteinen sairaus: 1
- ANO3anoctamin 3Yhteinen sairaus: 1
- ANO5anoctamin 5Yhteinen sairaus: 1
Geeniin COL6A3 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita COL6A3 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal joint hypermobility
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Neck flexion weakness
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
Näytä 25 piirrettä lisää
- Hunched back
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Increased wrist mobility
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Reduced spine movement
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Joint contracture
- Kyphoscoliosis
- Multiple joint contractures
- Neck muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Axial muscle weakness
- Double-Jointed
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
Abnormality of limbs
- Hip contracture
- Pelvic girdle muscle weakness
- Weak shoulder muscles
- Ankle contracture
- Increased laxity of fingers
- Knee contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
Näytä 16 piirrettä lisää
- Hip dislocation
- Inability to straighten knee
- Interphalangeal joint contracture of finger
- Inward turned thumb
- Limb-girdle muscle weakness
- Long toe
- Permanent flexion of the finger
- Pes valgus
- Quadriceps weakness
- Slender finger
- Wrist flexion contracture
- Curved toe bone
- Dislocated hip since birth
- Foot drop
- Shortening of the achilles tendon
- Winged shoulder blade
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Laryngeal dystonia
- Oromandibular dystonia
- Writer's cramp
- Abnormal gait
- Action tremor
- Axial dystonia
- Focal dystonia
Näytä 5 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). COL6A3-geeni: collagen type VI alpha 3 chain. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/col6a3
Dante Labs. COL6A3-geeni: collagen type VI alpha 3 chain [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/col6a3
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa