Gen
SIX3
SIX homeobox 3
- HGNC 10889↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000138083↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6496↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2p21
- Souřadnice
- Chromozom 2: 44 941 702–44 946 071 (GRCh38)
- Exony
- 2 exonů na 4,4 kb
- Protein
- 332 aminokyselin
- Předchozí symboly
- HPE2
- Transkript MANE Select
- ENST00000260653.5NM_005413.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SIX3 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Non-Acquired Combined Pituitary Hormone Deficiency
Congenital hypopituitarism is characterized by multiple pituitary hormone deficiency, including somatotroph, thyrotroph, lactotroph, corticotroph or gonadotroph deficiencies, due to mutations of pituitary transcription factors involved in pituitary ontogenesis.
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je SIX3 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,7 kb z 4,4 kb genu; 999 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SIX3
13
pozic v genu SIX3, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 4,4 kb genu SIX3, včetně intronů, nikoli jen 2,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedSdílí 1 onemocnění
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Sdílí 1 onemocnění
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Sdílí 1 onemocnění
- GLI2GLI family zinc finger 2Sdílí 1 onemocnění
- GLI3GLI family zinc finger 3Sdílí 1 onemocnění
- LHX3LIM homeobox 3Sdílí 1 onemocnění
- LHX4LIM homeobox 4Sdílí 1 onemocnění
- PLCH1phospholipase C eta 1Sdílí 1 onemocnění
- PTCH1patched 1Sdílí 1 onemocnění
- RBM28RNA binding motif protein 28Sdílí 1 onemocnění
- SHHsonic hedgehog signaling moleculeSdílí 1 onemocnění
- SMOsmoothened, frizzled class receptorSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SIX3
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SIX3. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
Zobrazit ještě 33 rysů
- Alobar holoprosencephaly
- Anxiety
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Impulsivity
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Semilobar holoprosencephaly
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Schizencephaly
- Small cerebellum
Abnormality of head or neck
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Midnasal stenosis
- Only one upper front tooth
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Both sided cleft lip
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
Zobrazit ještě 20 rysů
- Flat nose
- High palate
- Narrow nasal bridge
- Right and left cleft palate
- Short philtrum
- Tented mouth
- Absence of the intermaxillary bone
- Absence of the nasal bone
- Big calvaria
- Cleft of the mouth
- Frontoethmoidal encephalocele
- Midface retrusion
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Proboscis
- Short nose
- Absent nasal septal cartilage
- Central cleft palate
- Submucous cleft hard palate
- Zygomatic flattening
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
- Decreased response to growth hormone stimulation test
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal vertebral morphology
- Abnormality of the ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Acid reflux
- Constipation
- Poor swallowing
- Vomiting
- Abnormal shape of the digestive system
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the eye
- Abnormally close eyes
- Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Cerebral visual impairment
- Abnormally small eyeball
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Cat eye
- Cross-eyed
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SIX3: SIX homeobox 3. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/six3
Dante Labs. Gen SIX3: SIX homeobox 3 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/six3
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů