Gen
SIX3
SIX homeobox 3
- HGNC 10889↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000138083↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6496↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2p21
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 44.941.702–44.946.071 (GRCh38)
- Exons
- 2 exons over 4,4 kb
- Eiwit
- 332 aminozuren
- Eerdere symbolen
- HPE2
- MANE Select-transcript
- ENST00000260653.5NM_005413.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SIX3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Niet-verworven gecombineerd hypofysehormoondeficiëntiesyndroom
Congenitaal hypopituïtarisme wordt gekenmerkt door een tekort aan meerdere hypofysehormonen, waaronder tekorten aan somatotrofe, thyreotrofe, lactotrofe, corticotrofe of gonadotrofe cellen, als gevolg van mutaties in hypofysetranscriptiefactoren die betrokken zijn bij de ontwikkeling van de hypofyse.
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van SIX3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,7 kb van de 4,4 kb van het gen; 999 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SIX3 leest
13
posities in SIX3 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 4,4 kb van SIX3, inclusief introns, en niet alleen de 2,7 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedDeelt 1 aandoening
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Deelt 1 aandoening
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Deelt 1 aandoening
- GLI2GLI family zinc finger 2Deelt 1 aandoening
- GLI3GLI family zinc finger 3Deelt 1 aandoening
- LHX3LIM homeobox 3Deelt 1 aandoening
- LHX4LIM homeobox 4Deelt 1 aandoening
- PLCH1phospholipase C eta 1Deelt 1 aandoening
- PTCH1patched 1Deelt 1 aandoening
- RBM28RNA binding motif protein 28Deelt 1 aandoening
- SHHsonic hedgehog signaling moleculeDeelt 1 aandoening
- SMOsmoothened, frizzled class receptorDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SIX3
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SIX3 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
Toon 33 kenmerken meer
- Alobar holoprosencephaly
- Anxiety
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Impulsivity
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Semilobar holoprosencephaly
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Schizencephaly
- Small cerebellum
Abnormality of head or neck
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Midnasal stenosis
- Only one upper front tooth
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Both sided cleft lip
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
Toon 20 kenmerken meer
- Flat nose
- High palate
- Narrow nasal bridge
- Right and left cleft palate
- Short philtrum
- Tented mouth
- Absence of the intermaxillary bone
- Absence of the nasal bone
- Big calvaria
- Cleft of the mouth
- Frontoethmoidal encephalocele
- Midface retrusion
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Proboscis
- Short nose
- Absent nasal septal cartilage
- Central cleft palate
- Submucous cleft hard palate
- Zygomatic flattening
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
- Decreased response to growth hormone stimulation test
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal vertebral morphology
- Abnormality of the ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
Toon 3 kenmerken meer
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Acid reflux
- Constipation
- Poor swallowing
- Vomiting
- Abnormal shape of the digestive system
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the eye
- Abnormally close eyes
- Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Cerebral visual impairment
- Abnormally small eyeball
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Cat eye
- Cross-eyed
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SIX3-gen: SIX homeobox 3. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/six3
Dante Labs. SIX3-gen: SIX homeobox 3 [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/six3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken