Gene
KDM5C
lysine demethylase 5C
- HGNC 11114↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000126012↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 8242↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- Xp11.22
- Coordenadas
- Cromossoma X: 53 192 158–53 225 207 (GRCh38)
- Exões
- 26 exões ao longo de 33,1 kb
- Proteína
- 1560 aminoácidos
- Também conhecido como
- DXS1272E, XE169
- Símbolos anteriores
- SMCX, JARID1C, MRX13
- Transcrito MANE Select
- ENST00000375401.8NM_004187.5
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
Genoma de referênciaGRCh38hg38
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Epilepsia (Painel Completo)
- Perturbação Neurodesenvolvimental Complexa Ligada ao Cromossoma X
Uma perturbação neurodesenvolvimental complexa que se transmite por hereditariedade ligada ao cromossoma X e que se caracteriza por deficiência intelectual, autismo e epilepsia.
- A ClinGen classifica a associação como definitiva
- 1 submissor GenCC classifica-a como definitiva ou forte
Agrupamentos mais amplos
Deficiência Intelectual
Um de 233 genes ligados a este
- 4 submissores GenCC classificam-na como definitiva ou forte
Como KDM5C está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 5,8 kb dos 33,1 kb do gene; 4683 dessas bases codificam a proteína.
Como um teste de genoma lê KDM5C
89
posições em KDM5C onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.
Um genoma completo abrange todos os 33,1 kb de KDM5C, incluindo os intrões, e não apenas os 5,8 kb de exões.
Genes associados às mesmas condições
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Partilha 2 condições
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Partilha 2 condições
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Partilha 2 condições
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 4Partilha 2 condições
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Partilha 2 condições
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Partilha 2 condições
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Partilha 2 condições
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 1Partilha 2 condições
- IQSEC2IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 2Partilha 2 condições
- NEXMIFneurite extension and migration factorPartilha 2 condições
- PAK3p21 (RAC1) activated kinase 3Partilha 2 condições
- PCDH19protocadherin 19Partilha 2 condições
Características associadas a KDM5C
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que KDM5C pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem esta informação
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
- A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene KDM5C: lysine demethylase 5C. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/kdm5c
Dante Labs. Gene KDM5C: lysine demethylase 5C [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/kdm5c
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