Gène
KDM5C
lysine demethylase 5C
- HGNC 11114↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000126012↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 8242↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- Xp11.22
- Coordonnées
- Chromosome X : 53 192 158–53 225 207 (GRCh38)
- Exons
- 26 exons sur 33,1 kb
- Protéine
- 1 560 acides aminés
- Aussi appelé
- DXS1272E, XE169
- Symboles précédents
- SMCX, JARID1C, MRX13
- Transcrit MANE Select
- ENST00000375401.8NM_004187.5
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Épilepsie (panel complet)
- Trouble neurodéveloppemental complexe lié à l'X
Un trouble neurodéveloppemental complexe à transmission liée à l'X, caractérisé par une déficience intellectuelle, un autisme et une épilepsie.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort
Regroupements plus larges
Déficience intellectuelle
L'un des 233 gènes qui lui sont liés
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Structure de KDM5C
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,8 kb sur les 33,1 kb du gène ; 4 683 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit KDM5C
89
positions dans KDM5C où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 33,1 kb de KDM5C, introns compris, et pas seulement les 5,8 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Partage 2 affections
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Partage 2 affections
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Partage 2 affections
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 4Partage 2 affections
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Partage 2 affections
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Partage 2 affections
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Partage 2 affections
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 1Partage 2 affections
- IQSEC2IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 2Partage 2 affections
- NEXMIFneurite extension and migration factorPartage 2 affections
- PAK3p21 (RAC1) activated kinase 3Partage 2 affections
- PCDH19protocadherin 19Partage 2 affections
Traits associés à KDM5C
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que KDM5C peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène KDM5C : lysine demethylase 5C. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/kdm5c
Dante Labs. Gène KDM5C : lysine demethylase 5C [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/kdm5c
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