유전자
SPTLC1
serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1
요약
- 세포유전학적 위치
- 9q22.31
- 좌표
- 염색체 9: 92,031,147–92,115,413 (GRCh38)
- 엑손
- 엑손 15개, 84.3 kb에 걸쳐
- 단백질
- 아미노산 473개
- 다른 이름
- LCB1, SPTI, HSAN1, hLCB1
- 이전 기호
- HSN1
- MANE Select 전사체
- ENST00000262554.7NM_006415.4
- 유전자좌 유형
- Protein-coding
- Very high
- Confident
- Low
- Very low
이 페이지의 데이터
페이지 주소 끝에 .json을 붙이거나 application/json을 요청하면 JSON 형식으로 읽을 수 있습니다.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sptlc1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$name이 유전자와 관련된 큐레이션 보고서
근위축성 측삭경화증(ALS)
- 근위축성 측삭경화증
상위 및 하위 운동뉴런에 발생하는 신경퇴행성 질환으로, 산발형과 가족형 모두 나타납니다.
- 3명의 GenCC 제출자가 확정적 또는 강함으로 평가합니다
▶알면 달라지는 점
SOD1-ALS에 사용하는 토페르센(Qalsody, 2023년 FDA 승인), C9orf72 및 FUS에 대한 ASO 임상시험, riluzole, edaravone, AMX0035(sodium phenylbutyrate-taurursodiol), 다학제 ALS 클리닉 진료, 호흡 보조 요법, 가족 구성원을 위한 유전 상담
유전성 감각 및 자율신경병증(가족성 자율신경이상증 포함)
- 유전성 감각 및 자율신경병증
가족성 자율신경이상증(ELP1), HSAN1(SPTLC1/SPTLC2), HSAN2(WNK1, RETREG1), 선천성 통증 무감각증(NTRK1, SCN9A, PRDM12)을 포함하는 신경병증군입니다. 대부분은 열성 유전이며, HSAN1만 우성 유전입니다.
- ClinGen의 이 연관성 평가: 확정적
- 3명의 GenCC 제출자가 확정적 또는 강함으로 평가합니다
▶알면 달라지는 점
알아차리지 못한 부상, 화상, 감염으로부터의 보호, 자율신경 증상의 관리, 그리고 가족을 위한 보인자 검사(가족성 자율신경이상증은 아슈케나지 유대인 보인자 선별검사에 포함됩니다)를 권장합니다.
SPTLC1의 구조
- 코딩 서열
- 비번역 영역
- 인트론
- 전사 방향
- 알려진 질병 유발 부위
- 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간
v1.5 릴리스 기준, 이 유전자의 MANE Select 전사체 엑손이며 NCBI와 EMBL-EBI 자료를 바탕으로 하고 GRCh38 참조 게놈에 기반합니다.
Chromosome bands from UCSC's GRCh38 ideogram (2022-10-29).
Nearby genes from Ensembl release 116, on GRCh38.
유전자 전체 84.3 kb 중 엑손이 2.8 kb를 차지하며, 이 중 1,422개의 염기가 단백질을 암호화합니다.
전장 유전체 검사가 SPTLC1 유전자를 읽는 방법
12
SPTLC1 내 위치 중 ClinVar가 병원성 또는 가능성 높은 병원성으로 분류하는 위치
이 중 어느 곳도 짧은 리드가 판독하기 어려운 구간에 있지 않습니다.
전장 유전체 검사는 인트론을 포함해 SPTLC1의 전체 84.3kb를 모두 포함하며, 엑손 2.8kb만 보는 것이 아닙니다.
같은 질환과 연관된 유전자
- SPTLC2serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2질환 2개 공유
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1질환 1개 공유
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2질환 1개 공유
- ANGangiogenin질환 1개 공유
- ANXA11annexin A11질환 1개 공유
- ATL1atlastin GTPase 1질환 1개 공유
- ATL3atlastin GTPase 3질환 1개 공유
- C9orf72C9orf72-SMCR8 complex subunit질환 1개 공유
- CCNFcyclin F질환 1개 공유
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10질환 1개 공유
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2B질환 1개 공유
- CLCF1cardiotrophin like cytokine factor 1질환 1개 공유
Traits linked to SPTLC1
The Human Phenotype Ontology lists these as features of the rare conditions SPTLC1 can cause. Each trait's page lists the other genes linked to it.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Decreased touch sensation in extremities
- Hand tremor
- Impaired distal proprioception
- Abnormality of balance
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Decreased amplitude of sensory action potentials
Show 38 more traits
- Decreased sensation in extremities
- Lou Gehrig's disease
- Abnormal speech pattern
- Arm dystonia
- Brisk reflexes
- Bulbar signs
- CNS hypomyelination
- Decreased reflex response
- Delayed ability to walk
- Dystonia
- High stepping
- Impaired executive functioning
- Impaired temperature sensation
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Jaw hyperreflexia
- Loss of ability to walk
- Pain insensitivity
- Toe walking
- Trophic changes related to pain
- Abnormality of the cerebellum
- Ataxia
- Axial dystonia
- Behavioral abnormality
- Chorea
- Clonus
- Cognitive impairment
- Global developmental delay
- Head titubation
- Loss of articulate speech
- Motor axonal neuropathy
- Oromandibular dystonia
- Parkinsonism
- Absent reflexes
- Chronic axonal neuropathy
- Decreased number of large peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased sensory nerve conduction velocity
- Distal sensory impairment of all modalities
Abnormality of the musculoskeletal system
- Angulated muscle fibers
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Fiber type grouping
- Frequent falls
- Generalized muscle weakness
- Muscle degeneration
- Progressive muscle weakness
- Weakness of outermost muscles
Show 19 more traits
- Distal muscle wasting
- Lower limb spasticity
- Muscle weakness
- Uncontrollable movement in upper arms
- Gowers sign
- Limb pain
- Lower-limb joint contracture
- Muscle fiber degeneration
- Prominent swayback
- Scoliosis
- Spastic diplegia
- Spasticity and rigidity of muscles
- Upper-limb joint contracture
- EMG: slow motor conduction
- Neck flexion weakness
- Neuropathic arthropathy
- Opisthotonus
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Spontaneous fracture
외부 링크
단백질
이 정보의 출처
- HGNC: 유전자의 기호, 명칭, 다른 기호 및 위치입니다.
- NCBI와 EMBL-EBI의 MANE Select v1.5: 전사체, 엑손 및 코딩 서열입니다.
- GenCC와 ClinGen, 2026-10-17 공개본: 해당 유전자와 연관된 질환과 그 연관성의 강도입니다.
- ACMG 이차 소견 목록, SF v3.2입니다.
- ClinVar와 GIAB 층화 자료: 알려진 질병 유발 부위와 짧은 리드(short read)로 분석하기 어려운 영역입니다.
- The Human Phenotype Ontology, release 2026-09-01: the traits linked to the gene. Find out more at hpo.jax.org.
- 데이터 릴리스 2026.10.17-8666dff2.
Cite this page
Dante Labs. (n.d.). SPTLC1 gene: serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1. Retrieved 2026년 10월 17일, from https://dantelabs.com/ko/genes/sptlc1
Dante Labs. SPTLC1 gene: serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 [Internet]. [cited 2026년 10월 17일]. Available from: https://dantelabs.com/ko/genes/sptlc1
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