Geeni
PEX6
peroxisomal biogenesis factor 6
- HGNC 8859↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000124587↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5190↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6p21.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 42 963 865–42 979 181 (GRCh38)
- Eksonit
- 17 eksonia 15,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 980 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- PXAAA1, PAF-2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000304611.13NM_000287.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PEX6 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Zellweger-spektrin häiriöt ja peroksisomien muodostumishäiriöt
- Peroksisomien muodostumishäiriöt (Zellweger-spektri ja rhizomelinen chondrodysplasia punctata)Autosomaalinen resessiivinen
Muutokset millä tahansa yli tusinasta PEX-geenistä, useimmiten PEX1-geenistä, vaikuttavat aivoihin, maksaan, munuaisiin, luihin, silmiin ja kuuloon. Vaikeusaste vaihtelee elämää rajoittavasta sairaudesta imeväisiässä lieviin näkö-, kuulo- ja oppimisongelmiin.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Diagnoosi ohjaa maksan, lisämunuaisten, näön ja kuulon toiminnan seurantaa, tarvittaessa ravintolisien käyttöä sekä sukulaisten kantajatestausta.
Laajemmat ryhmät
Perinnölliset autosomaalisesti resessiiviset pikkuaivoataksiat (mm. CANVAS ja AVED)
- Autosomaalisesti resessiivinen pikkuaivoataksiaAutosomaalinen resessiivinen
Yksi 57 siihen liittyvästä geenistä
Ryhmä resessiivisesti periytyviä ataksioita, joita aiheuttavat biallelliset variantit geeneissä, kuten RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 ja SYNE1.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
E-vitamiinin puutokseen liittyvää ataksiaa (TTPA) voidaan hoitaa E-vitamiinilisillä. Muita muotoja hoidetaan fysioterapialla ja oireenmukaisella hoidolla, ja sukulaisille voidaan tarjota kantajatestausta.
Muut perinnölliset leukodystrofiat
- Leukodystrofia (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 80 siihen liittyvästä geenistä
Perinnölliset sairaudet, jotka vahingoittavat myeliinituppea eli aivojen ja selkäytimen valkeaa ainetta tai estävät sen normaalin muodostumisen. Eri tyypit periytyvät autosomaalisesti resessiivisesti, autosomaalisesti dominantisti tai X-kromosomaalisesti sen mukaan, mikä geeni on kyseessä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedossa oleva geneettinen syy voi lopettaa diagnoosin etsimisen, ohjata tukihoitoa ja seurantaa, osoittaa, onko olemassa tiettyä hoitoa, sekä mahdollistaa sukulaisten testauksen.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PEX6-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 15,3 kb:stä; 2 943 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PEX6
273
PEX6-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 15,3 kb geenistä PEX6, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CYP27A1cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX1peroxisomal biogenesis factor 1Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX10peroxisomal biogenesis factor 10Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX11Bperoxisomal biogenesis factor 11 betaYhteisiä sairauksia: 2
- PEX12peroxisomal biogenesis factor 12Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX13peroxisomal biogenesis factor 13Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX14peroxisomal biogenesis factor 14Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX16peroxisomal biogenesis factor 16Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX19peroxisomal biogenesis factor 19Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX2peroxisomal biogenesis factor 2Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX26peroxisomal biogenesis factor 26Yhteisiä sairauksia: 2
- PEX3peroxisomal biogenesis factor 3Yhteisiä sairauksia: 2
Geeniin PEX6 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PEX6 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Amelogenesis imperfecta
- Depressed nasal bridge
- Epicanthus inversus
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Abnormal dentition
- Abnormal nasolacrimal system morphology
- Abnormal tooth enamel
- Abnormality of the eyebrow
Näytä 26 piirrettä lisää
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of the palate
- Eye folds
- Flat face
- High forehead
- Long, narrow head
- Nasal tip, upturned
- Taurodontia
- Thin eyebrow
- Wide nasal bridge
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Flat back of skull
- Flattened bony protrusion above eyes
- High palate
- Little lower jaw
- Round face
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Abnormality of the face
- Abnormality of the tongue
- Bell's palsy
- High frontal hairline
- Thickened skin folds of neck
- Dental crowding
- Short nose
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of movement
- Cognitive impairment
- Diminished deep tendon reflex
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability
Näytä 18 piirrettä lisää
- Loss of developmental milestones
- Profound global developmental delay
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Abnormality of neuronal migration
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Damage to nerves that sense feeling
- Head tremor
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Inability to coordinate movements when walking
- More grooves in brain
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Progressive cerebellar ataxia
- Spinocerebellar atrophy
- Decreased reflex response
- Peripheral neuropathy
- Decreased nerve conduction velocity
Abnormality of the genitourinary system
- Underdevelopment of external reproductive organs
- Enlarged clitoris
- Hydronephrosis
- Hypospadias
- Multicystic kidney dysplasia
- Primary amenorrhea
- Undescended testes
- Cystic kidney disease
Näytä 1 piirre lisää
Abnormality of the integument
- Beau's lines
- Abnormal fingernails
- Abnormal hair quantity
- Abnormality of nail color
- Abnormality of the toenail
- Flattened and twisted hair
- White discoloration of nails
- Darkened and thickened skin
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PEX6-geeni: peroxisomal biogenesis factor 6. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pex6
Dante Labs. PEX6-geeni: peroxisomal biogenesis factor 6 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pex6
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa