Geen
ACTA1
actin alpha 1, skeletal muscle
- HGNC 129↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000143632↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 58↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1q42.13
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 229 431 245–229 434 094 (GRCh38)
- Eksonid
- 7 eksonit, ulatus 2,9 kb
- Valk
- 377 aminohapet
- Tuntud ka kui
- NEM3
- Varasemad tähised
- ACTA
- MANE Select transkript
- ENST00000366684.7NM_001100.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe ACTA1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kaasasündinud müopaatiad
- ACTA1-ga seotud müopaatia (alfa-aktinopaatia)
Kaasasündinud ja täiskasvanueas avalduvate müopaatiate spekter, mida põhjustavad skeletilihase alfa-aktiini geeni ACTA1 variandid ja mille puhul esineb nõrkust, madalat lihastoonust ja hingamisraskusi.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Nemaliinne müopaatia
Kaasasündinud müopaatia, mida iseloomustavad lihaskiududes varrasekujulised struktuurid ja mis on enamasti põhjustatud NEB või ACTA1 variantidest.
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas ACTA1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,5 kb kogupikkusega 2,9 kb; neist 1134 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ACTA1
166
kohad geenis ACTA1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ACTA1 2,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,5 kb).
Variandid, millel on leht (39)
Siin on ACTA1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.617-5C>A | Intron 4 | 229 432 190 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.687G>C | Ekson 5 | 229 432 115 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.990+1G>T | Intron 6 | 229 431 720 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| C376F | c.1127G>T | Ekson 7 | 229 431 506 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| C376S | c.1127G>C | Ekson 7 | 229 431 506 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D13E | c.39C>A | Ekson 2 | 229 433 077 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D13N | c.37G>A | Ekson 2 | 229 433 079 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D58N | c.172G>A | Ekson 3 | 229 432 838 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D181Tfs*11 | c.541del | Ekson 4 | 229 432 344 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D290H | c.868G>C | Ekson 6 | 229 431 843 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- CFL2cofilin 2Jagab 1 haigust
- KBTBD13kelch repeat and BTB domain containing 13Jagab 1 haigust
- KLHL40kelch like family member 40Jagab 1 haigust
- KLHL41kelch like family member 41Jagab 1 haigust
- LMOD3leiomodin 3Jagab 1 haigust
- MYPNmyopalladinJagab 1 haigust
- NEBnebulinJagab 1 haigust
- SELENONselenoprotein NJagab 1 haigust
- TNNT1troponin T1, slow skeletal typeJagab 1 haigust
- TPM2tropomyosin 2Jagab 1 haigust
- TPM3tropomyosin 3Jagab 1 haigust
Geeniga ACTA1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ACTA1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormality of skeletal muscle fiber size
- Generalized decreased muscle tone
- Generalized muscle weakness
- Increased connective tissue
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Joint contracture
- Low muscle tone
Näita veel 56 tunnust
- Muscle degeneration
- Neck flexion weakness
- Poor head control
- Type 1 muscle fiber predominance
- Abnormally shaped skeletal
- Autophagic vacuoles
- Axial muscle weakness
- Difficulty walking up stairs
- EMG: myopathic abnormalities
- Gowers sign
- Handgrip myotonia
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Muscle fiber splitting
- Muscle tissue disease
- Myofibrillar myopathy
- Neck muscle weakness
- Progressive muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
- Rimmed vacuoles
- Scoliosis
- Severely decreased muscle tone
- Type 1 muscle fiber atrophy
- Weakness of outermost muscles
- Abnormality of the chest
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of distal limb muscles
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle wasting
- Hamstring contractures
- Multiple fractures present at birth
- Muscle fiber necrosis
- Muscle stiffness
- Prominent swayback
- Thoracic scoliosis
- Tired easily
- Weakness of muscles of respiration
- Abnormality of the diaphragm
- Arthrogryposis multiplex congenita
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatiguable weakness of proximal limb muscles
- Funnel chest
- Kyphoscoliosis
- Muscle weakness between ribs
- Narrow chest
- Poorly developed skeletal musculature
- Rigidity
- Spasticity and rigidity of muscles
- Thin ribs
- Hunched back
- Bulbar palsy
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- EMG: neuropathic changes
- Frequent falls
- Late-onset distal muscle weakness
Abnormality of limbs
- Joint contracture of the hand
- Limb-girdle muscular dystrophy
- Winged shoulder blade
- Wrist drop
- Elbow flexion contracture
- Foot drop
- Hip contracture
- Knee contracture
Näita veel 16 tunnust
- Limb muscle weakness
- Limb-girdle muscle weakness
- Ankle flexion contracture
- Club feet
- Dislocated hip since birth
- Flexion contracture of finger
- High-arched foot
- Hip dislocation
- Inability to straighten knee
- Inward turned thumb
- Knock knees
- Outward bow-leggedness
- Pelvic girdle muscle weakness
- Weak shoulder muscles
- Hand muscle degeneration
- Shortening of the achilles tendon
Abnormality of the respiratory system
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Respiratory function loss
- Abnormality of the respiratory system
- Abnormality on pulmonary function testing
- Breathing difficulties
- High blood carbon dioxide level
- Low blood oxygen level
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Tube feeding
- Poor swallowing
- Gastrostomy tube feeding in infancy
- Nasogastric tube feeding
- Neuromuscular dysphagia
- Poor appetite
- Feeding difficulties in infancy
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ACTA1 geen: actin alpha 1, skeletal muscle. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/acta1
Dante Labs. ACTA1 geen: actin alpha 1, skeletal muscle [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/acta1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast