Geen
NEB
nebulin
- HGNC 7720↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000183091↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 4703↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q23.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 151 485 339–151 734 476 (GRCh38)
- Eksonid
- 182 eksonit, ulatus 249,1 kb
- Valk
- 8525 aminohapet
- Tuntud ka kui
- NEB177D
- Varasemad tähised
- NEM2
- MANE Select transkript
- ENST00000397345.8NM_001164508.2
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe NEB ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kaasasündinud müopaatiad
- Nemaliinne müopaatia
Kaasasündinud müopaatia, mida iseloomustavad lihaskiududes varrasekujulised struktuurid ja mis on enamasti põhjustatud NEB või ACTA1 variantidest.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas NEB on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 26,2 kb kogupikkusega 249,1 kb; neist 25 578 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse NEB
1802
kohad geenis NEB, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 187 (10%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (187 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (154 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni NEB 249,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (26,2 kb).
Variandid, millel on leht (9)
Siin on NEB variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.78+1G>A | Intron 4 | 151 729 614 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.6076-1G>T | Intron 47 | 151 658 091 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.11910+1G>A | Intron 79 | 151 610 761 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.19944G>A | Ekson 129 | 151 551 738 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| D498G | c.1493A>G | Ekson 17 | 151 696 713 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R2313X | c.6937C>T | Ekson 53 | 151 650 864 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R7997X | c.23989C>T | Ekson 168 | 151 501 423 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| S6366I | c.19097G>T | Ekson 122 | 151 561 212 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| T7382P | c.22144A>C | Ekson 150 | 151 525 975 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- ACTA1actin alpha 1, skeletal muscleJagab 1 haigust
- CFL2cofilin 2Jagab 1 haigust
- KBTBD13kelch repeat and BTB domain containing 13Jagab 1 haigust
- KLHL40kelch like family member 40Jagab 1 haigust
- KLHL41kelch like family member 41Jagab 1 haigust
- LMOD3leiomodin 3Jagab 1 haigust
- MYPNmyopalladinJagab 1 haigust
- SELENONselenoprotein NJagab 1 haigust
- TNNT1troponin T1, slow skeletal typeJagab 1 haigust
- TPM2tropomyosin 2Jagab 1 haigust
- TPM3tropomyosin 3Jagab 1 haigust
Geeniga NEB seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida NEB võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Arthrogryposis multiplex congenita
- EMG: myopathic abnormalities
- Generalized muscle weakness
- Muscle tissue disease
- Severely decreased muscle tone
- Abnormality of the chest
- Axial muscle weakness
- Fatigable weakness of distal limb muscles
Näita veel 38 tunnust
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle wasting
- Increased connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Multiple fractures present at birth
- Muscle degeneration
- Muscle stiffness
- Neck flexion weakness
- Progressive distal muscle weakness
- Reduced spine movement
- Sternocleidomastoid amyotrophy
- Type 1 muscle fiber predominance
- Abnormality of the diaphragm
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Fatiguable weakness of proximal limb muscles
- Frequent falls
- Funnel chest
- Generalized decreased muscle tone
- Muscle fiber splitting
- Narrow chest
- Neck muscle weakness
- Progressive proximal muscle weakness
- Prominent swayback
- Rimmed vacuoles
- Scoliosis
- Thin ribs
- Tired easily
- Hunched back
- Abnormality of the rib cage
- Bulbar palsy
- Congenital contracture
- EMG: neuropathic changes
- Late-onset distal muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
Abnormality of head or neck
- Weakness of facial musculature
- Bell's palsy
- High palate
- Myopathic facies
- Narrow mouth
- Facial diplegia
- High, narrow palate
- Little lower jaw
Näita veel 6 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). NEB geen: nebulin. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/neb
Dante Labs. NEB geen: nebulin [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/neb
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast