Gen
XYLT1
xylosyltransferase 1
- HGNC 15516↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000103489↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 64131↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 16p12.3
- Coordenadas
- Cromosoma 16: 17.101.769–17.470.960 (GRCh38)
- Exones
- 12 exones en 369,2 kb
- Proteína
- 959 aminoácidos
- Herencia
- Autosómica recesiva
- También conocido como
- XT-I, PXYLT1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000261381.7NM_022166.4
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
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Displasias epifisarias y espondiloepifisarias
- Displasia de Desbuquois 2Autosómica recesiva
Talla baja, laxitud articular y alteraciones en las manos causadas por variantes en XYLT1.
- 3 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Herencia
- Autosómica recesiva
- Se necesita una copia alterada de cada progenitor. Con una sola, es portador y normalmente no presenta la afección; cuando ambos progenitores son portadores, cada hijo tiene una probabilidad de uno entre cuatro de heredar dos.
Estructura de XYLT1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 10 kb de los 369,2 kb del gen; 2880 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen XYLT1
6
posiciones en XYLT1 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
Un genoma completo cubre los 369,2 kb de XYLT1, incluidos los intrones, y no solo los 10 kb de exones.
Rasgos asociados a XYLT1
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que XYLT1 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of limbs
- Accelerated wrist bone maturation
- Broad wide portion of long bone
- Prominent lesser trochanter
- Abnormal neck or head of thigh bone
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Dislocated kneecap
- Knee dislocation
- Permanent flexion of the finger
Mostrar 23 rasgos más
- Back knee
- Broad thumb
- Coxa valga
- Coxa vara
- Curvature of digit
- Curvature of little finger
- Dropped arches
- Elbow dislocation
- Flared wide portion of long bone
- Fused forearm bones
- Hip dislocation
- Monkey wrench femoral neck
- Short neck of thighbone
- Small hand
- Broad foot
- Single transverse palmar crease
- Toe curvature
- Cutaneous syndactyly
- Flat acetabular roof
- Front half of foot turns inward
- Outward bow-leggedness
- Short finger bones
- Shortened long bone of hand
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Retinal peau d'orange
- Angioid streaks
- Glaucoma
- Blue outer white part of eyeball
- Choroidal neovascularization
- Visual impairment
- Close sighted
Mostrar 3 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen XYLT1: xylosyltransferase 1. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/xylt1
Dante Labs. Gen XYLT1: xylosyltransferase 1 [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/xylt1
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