Geeni
XYLT1
xylosyltransferase 1
- HGNC 15516↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000103489↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 64131↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16p12.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 17 101 769–17 470 960 (GRCh38)
- Eksonit
- 12 eksonia 369,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 959 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- XT-I, PXYLT1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000261381.7NM_022166.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue XYLT1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Epifyysi- ja spondyloepifyysidysplasiat
- Desbuquois-dysplasia 2Autosomaalinen resessiivinen
XYLT1-varianttien aiheuttama lyhytkasvuisuus, nivelten löysyys ja käsien muutokset.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
XYLT1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 10 kb geenin 369,2 kb:stä; 2 880 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä XYLT1
6
XYLT1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 369,2 kb geenistä XYLT1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 10 kb eksoneja.
Geeniin XYLT1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita XYLT1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of limbs
- Accelerated wrist bone maturation
- Broad wide portion of long bone
- Prominent lesser trochanter
- Abnormal neck or head of thigh bone
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Dislocated kneecap
- Knee dislocation
- Permanent flexion of the finger
Näytä 23 piirrettä lisää
- Back knee
- Broad thumb
- Coxa valga
- Coxa vara
- Curvature of digit
- Curvature of little finger
- Dropped arches
- Elbow dislocation
- Flared wide portion of long bone
- Fused forearm bones
- Hip dislocation
- Monkey wrench femoral neck
- Short neck of thighbone
- Small hand
- Broad foot
- Single transverse palmar crease
- Toe curvature
- Cutaneous syndactyly
- Flat acetabular roof
- Front half of foot turns inward
- Outward bow-leggedness
- Short finger bones
- Shortened long bone of hand
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Retinal peau d'orange
- Angioid streaks
- Glaucoma
- Blue outer white part of eyeball
- Choroidal neovascularization
- Visual impairment
- Close sighted
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). XYLT1-geeni: xylosyltransferase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/xylt1
Dante Labs. XYLT1-geeni: xylosyltransferase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/xylt1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa